Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm22013-201ENSMUST00000158788 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccdc6D3YZP9 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccdc6D3YZP9 Snord16a-201ENSMUST00000083895 99 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccdc6D3YZP9 AC161271.1-201ENSMUST00000226914 150 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccdc6D3YZP9 Gm26131-201ENSMUST00000082725 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccdc6D3YZP9 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc6D3YZP9 Gm26233-201ENSMUST00000175530 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc6D3YZP9 Mir7057-201ENSMUST00000184685 58 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc6D3YZP9 Gm23573-201ENSMUST00000104408 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm25862-201ENSMUST00000158250 129 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm22746-201ENSMUST00000082494 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm23831-201ENSMUST00000158895 85 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm21830-201ENSMUST00000178898 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Mir6961-201ENSMUST00000183874 67 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm23308-201ENSMUST00000179475 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm24704-201ENSMUST00000093715 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccdc6D3YZP9 Gm26262-201ENSMUST00000158024 127 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm24003-201ENSMUST00000158455 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Mir29b-1-201ENSMUST00000083670 71 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm22938-201ENSMUST00000103956 120 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm22357-201ENSMUST00000082882 83 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm22197-201ENSMUST00000116866 58 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm26139-201ENSMUST00000180098 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 mt-Ts1-201ENSMUST00000082403 69 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 AC154832.1-201ENSMUST00000228928 141 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Snord8-201ENSMUST00000175303 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccdc6D3YZP9 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccdc6D3YZP9 Mir297b-201ENSMUST00000102268 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ccdc6D3YZP9 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ccdc6D3YZP9 Gm37646-201ENSMUST00000191756 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ccdc6D3YZP9 Gm25903-201ENSMUST00000158492 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ccdc6D3YZP9 Mir1969-201ENSMUST00000157623 94 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ccdc6D3YZP9 Gm24297-201ENSMUST00000158300 68 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ccdc6D3YZP9 Gm43943-201ENSMUST00000204201 113 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ccdc6D3YZP9 Snord123-201ENSMUST00000158692 71 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ccdc6D3YZP9 Gm23974-201ENSMUST00000083321 131 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ccdc6D3YZP9 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccdc6D3YZP9 Gm24051-201ENSMUST00000158622 75 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccdc6D3YZP9 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm23216-201ENSMUST00000179545 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm10663-201ENSMUST00000098716 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm25779-201ENSMUST00000116710 95 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm25995-201ENSMUST00000175396 142 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm25465-201ENSMUST00000157716 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Mir543-201ENSMUST00000102286 76 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm27944-201ENSMUST00000185155 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Mir367-201ENSMUST00000083479 75 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Mirlet7b-201ENSMUST00000083630 85 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm24673-201ENSMUST00000116948 124 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm24775-201ENSMUST00000157377 99 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm23992-201ENSMUST00000174981 67 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm23108-201ENSMUST00000178295 124 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm23787-201ENSMUST00000122538 73 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Ccdc6D3YZP9 Gm44347-201ENSMUST00000199602 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Ccdc6D3YZP9 AC122210.2-201ENSMUST00000220216 115 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Ccdc6D3YZP9 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ccdc6D3YZP9 n-R5s153-201ENSMUST00000083451 116 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ccdc6D3YZP9 Gm23613-201ENSMUST00000082596 87 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ccdc6D3YZP9 Mir295-201ENSMUST00000104694 69 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc6D3YZP9 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc6D3YZP9 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Ccdc6D3YZP9 Gm25023-201ENSMUST00000082977 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Ccdc6D3YZP9 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ccdc6D3YZP9 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ccdc6D3YZP9 Gm24097-201ENSMUST00000178720 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ccdc6D3YZP9 Gm22602-201ENSMUST00000157596 95 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.6 ms