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Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7
Sgo1, Shugoshin 1, mouse
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Sgo1
Q9CXH7
Gm24988-201
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121 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
Gm25417-201
ENSMUST00000104212
131 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
Gm19248-201
ENSMUST00000209404
110 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
Gm24091-201
ENSMUST00000082550
83 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
Gm23711-201
ENSMUST00000083856
83 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
Gm23173-201
ENSMUST00000157161
160 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
Sgo1
Q9CXH7
Gm22539-201
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117 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
Sgo1
Q9CXH7
Gm22454-201
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107 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
Sgo1
Q9CXH7
Gm24946-201
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106 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Sgo1
Q9CXH7
Snord8-201
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110 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Sgo1
Q9CXH7
Mir6964-201
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59 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Sgo1
Q9CXH7
Gm22805-201
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107 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Sgo1
Q9CXH7
Mirlet7b-201
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85 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Sgo1
Q9CXH7
Gm23904-201
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124 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Sgo1
Q9CXH7
Gm23590-201
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104 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Sgo1
Q9CXH7
Gm23199-201
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107 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
Gm27798-201
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71 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
Mir136-201
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BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
Gm25652-201
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103 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
Mir702-201
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109 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
Gm11333-201
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148 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
Gm24197-201
ENSMUST00000175085
109 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
Mir7057-201
ENSMUST00000184685
58 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
Gm21836-201
ENSMUST00000178787
63 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
Gm27944-201
ENSMUST00000185155
103 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
Gm22305-201
ENSMUST00000082690
108 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
Gm22251-201
ENSMUST00000083216
107 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
Mir1948-201
ENSMUST00000157325
85 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
Mir7055-201
ENSMUST00000197423
59 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
Gm23613-201
ENSMUST00000082596
87 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
n-R5s153-201
ENSMUST00000083451
116 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
Sgo1
Q9CXH7
9230110F11Rik-202
ENSMUST00000212907
191 nt
TSL 5
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Gm22429-201
ENSMUST00000158553
130 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Gm25712-201
ENSMUST00000158634
93 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Gm23216-201
ENSMUST00000179545
107 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Trgj1-201
ENSMUST00000200495
60 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Gm24701-201
ENSMUST00000101946
105 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Gm25225-201
ENSMUST00000158197
102 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Gm23570-201
ENSMUST00000083029
104 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Mir15b-201
ENSMUST00000083646
64 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Gm23166-201
ENSMUST00000157164
101 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Gm22016-201
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BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Gm24674-201
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104 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Gm23308-201
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107 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Gm27987-201
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93 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Traj34-201
ENSMUST00000103707
58 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Gm23607-201
ENSMUST00000104550
126 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
CT030170.1-201
ENSMUST00000222183
148 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
CT571266.1-201
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BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
Sgo1
Q9CXH7
Mir7231-201
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61 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Gm44481-201
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BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Gm44339-201
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84 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
AC122335.1-201
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175 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Mir1839-201
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127 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Mir6339-201
ENSMUST00000185120
117 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Mir6957-201
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64 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Gm23038-201
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104 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Mir297b-201
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109 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Gm24047-201
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104 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Gm23652-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Gm26043-201
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BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Mir466m-201
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84 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Snord16a-201
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99 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Gm44589-201
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BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Mir3064-201
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BASIC
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□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Gm23240-201
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121 nt
BASIC
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□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Gm24459-201
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BASIC
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□□□□□ -2.64
Sgo1
Q9CXH7
Gm23630-201
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BASIC
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Sgo1
Q9CXH7
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BASIC
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□□□□□ -2.65
Sgo1
Q9CXH7
Snord50a-201
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BASIC
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□□□□□ -2.65
Sgo1
Q9CXH7
Gm24463-201
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72 nt
BASIC
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□□□□□ -2.65
Sgo1
Q9CXH7
Gm24203-201
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114 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
Sgo1
Q9CXH7
Gm11111-201
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99 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.65
Sgo1
Q9CXH7
Mirlet7a-2-201
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96 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
Sgo1
Q9CXH7
Mir297-1-201
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76 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
Sgo1
Q9CXH7
Gm26104-201
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108 nt
BASIC
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□□□□□ -2.65
Sgo1
Q9CXH7
mt-Ts1-201
ENSMUST00000082403
69 nt
BASIC
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□□□□□ -2.65
Sgo1
Q9CXH7
Gm26491-201
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121 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
Sgo1
Q9CXH7
Snord57-201
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72 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
Sgo1
Q9CXH7
Gm43943-201
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113 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Gm22950-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Mir494-201
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85 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Gm24554-201
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73 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Gm24495-201
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79 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Gm22253-201
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79 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Gm23974-201
ENSMUST00000083321
131 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Gm25022-201
ENSMUST00000102205
83 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Gm23909-201
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131 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Gm21961-201
ENSMUST00000110100
114 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Gm25158-201
ENSMUST00000177681
121 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Mir467a-6-201
ENSMUST00000177790
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BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Mir467a-3-201
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BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Mir467a-7-201
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BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
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83 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Mir467a-5-201
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BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Mir467a-2-201
ENSMUST00000179447
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BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Gm26229-201
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121 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Mir467a-9-201
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83 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Sgo1
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Mir467a-4-201
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-1.57
□□□□□ -2.66
Sgo1
Q9CXH7
Mir467a-8-201
ENSMUST00000180070
83 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
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