Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm21830-201ENSMUST00000178898 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0,62□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC-0,65□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC-0,65□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC-0,65□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC-0,65□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0,65□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC-0,65□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm22305-201ENSMUST00000082690 108 ntBASIC-0,65□□□□□ -2,51
Ctu1Q99J10 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC-0,66□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-0,66□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC-0,66□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm24674-201ENSMUST00000179194 104 ntBASIC-0,66□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-0,66□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC-0,66□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC-0,67□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0,67□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm23613-201ENSMUST00000082596 87 ntBASIC-0,67□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC-0,68□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC-0,68□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC-0,68□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC-0,68□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC-0,68□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm19248-201ENSMUST00000209404 110 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Mir297b-201ENSMUST00000102268 109 ntBASIC-0,71□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm23909-201ENSMUST00000104598 131 ntBASIC-0,71□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm23308-201ENSMUST00000179475 107 ntBASIC-0,71□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-0,71□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC-0,71□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC-0,71□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm26125-201ENSMUST00000083357 107 ntBASIC-0,71□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0,72□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm25712-201ENSMUST00000158634 93 ntBASIC-0,72□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC-0,72□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC-0,72□□□□□ -2,52
Ctu1Q99J10 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-0,75□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-0,75□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Mir136-201ENSMUST00000199494 62 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0,76□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC-0,76□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0,76□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC-0,76□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC-0,76□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Snord16a-201ENSMUST00000083895 99 ntBASIC-0,76□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC-0,77□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0,78□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Mir7057-201ENSMUST00000184685 58 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Gm44589-201ENSMUST00000207025 115 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Ctu1Q99J10 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC-0,79□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC-0,79□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Mir1839-201ENSMUST00000175366 127 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm25225-201ENSMUST00000158197 102 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm43943-201ENSMUST00000204201 113 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 AC161271.1-201ENSMUST00000226914 150 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 n-R5s153-201ENSMUST00000083451 116 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC-0,83□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC-0,83□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Snord123-201ENSMUST00000158692 71 ntBASIC-0,83□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC-0,83□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC-0,83□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC-0,83□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Ctu1Q99J10 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98,6 ms