Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6
Syne1, Nesprin-1, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm22909-201 | ENSMUST00000179190 | 79 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm26334-201 | ENSMUST00000179403 | 79 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25463-201 | ENSMUST00000179405 | 79 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25742-201 | ENSMUST00000179530 | 79 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25209-201 | ENSMUST00000179576 | 79 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm26392-201 | ENSMUST00000179661 | 79 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25230-201 | ENSMUST00000179740 | 79 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm26434-201 | ENSMUST00000179778 | 79 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25741-201 | ENSMUST00000179825 | 79 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm24759-201 | ENSMUST00000179827 | 79 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm24219-201 | ENSMUST00000179861 | 79 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm27905-201 | ENSMUST00000184005 | 207 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm42844-201 | ENSMUST00000200355 | 112 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | mt-Tt-201 | ENSMUST00000082422 | 67 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm22973-201 | ENSMUST00000083298 | 191 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm24099-201 | ENSMUST00000083384 | 107 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25087-201 | ENSMUST00000101992 | 78 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm24131-201 | ENSMUST00000158539 | 107 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm43505-201 | ENSMUST00000200579 | 139 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm26467-201 | ENSMUST00000097257 | 78 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm22677-201 | ENSMUST00000116977 | 108 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Mir466f-3-201 | ENSMUST00000104788 | 94 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Mir466f-2-201 | ENSMUST00000104805 | 94 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm44481-201 | ENSMUST00000197288 | 84 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Mir297-1-201 | ENSMUST00000103800 | 76 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm29107-201 | ENSMUST00000190910 | 347 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Igkv13-78-1-201 | ENSMUST00000199298 | 200 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm37845-201 | ENSMUST00000194977 | 355 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm43206-201 | ENSMUST00000197990 | 114 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Mir466e-201 | ENSMUST00000198862 | 84 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Mir466c-1-201 | ENSMUST00000200654 | 84 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | AC238676.2-201 | ENSMUST00000220910 | 94 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm22681-201 | ENSMUST00000083853 | 106 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm24106-201 | ENSMUST00000175498 | 127 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm26307-201 | ENSMUST00000157767 | 126 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm27987-201 | ENSMUST00000184023 | 93 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm23468-201 | ENSMUST00000157125 | 108 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm22296-201 | ENSMUST00000083310 | 103 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm24016-201 | ENSMUST00000157726 | 68 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | mt-Tv-201 | ENSMUST00000082389 | 69 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm26441-201 | ENSMUST00000082590 | 104 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25397-201 | ENSMUST00000176951 | 92 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Mir664-201 | ENSMUST00000196796 | 69 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm22286-201 | ENSMUST00000179708 | 107 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm10813-201 | ENSMUST00000099936 | 90 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm22101-201 | ENSMUST00000157928 | 103 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm26231-201 | ENSMUST00000175218 | 67 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm24646-201 | ENSMUST00000157109 | 99 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm24797-201 | ENSMUST00000178103 | 107 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm22255-201 | ENSMUST00000177933 | 79 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm24259-201 | ENSMUST00000083740 | 107 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm23254-201 | ENSMUST00000097244 | 79 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,51 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm23990-201 | ENSMUST00000117031 | 117 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm26194-201 | ENSMUST00000175036 | 71 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Mir28c-201 | ENSMUST00000200096 | 75 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm44932-201 | ENSMUST00000206799 | 121 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm26225-201 | ENSMUST00000082508 | 135 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | n-R5s218-201 | ENSMUST00000122583 | 109 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Mir6395-201 | ENSMUST00000183885 | 91 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm27882-201 | ENSMUST00000184904 | 74 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm22879-201 | ENSMUST00000082895 | 74 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm23543-201 | ENSMUST00000158207 | 106 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm23258-201 | ENSMUST00000158319 | 106 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm27845-201 | ENSMUST00000184479 | 114 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Mir493-201 | ENSMUST00000103837 | 83 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm24724-201 | ENSMUST00000158230 | 107 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25681-201 | ENSMUST00000083938 | 106 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25542-201 | ENSMUST00000116889 | 94 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm22349-201 | ENSMUST00000157864 | 107 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | AC157278.1-201 | ENSMUST00000221621 | 148 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm26474-201 | ENSMUST00000116762 | 122 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm10351-201 | ENSMUST00000087694 | 125 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm23651-201 | ENSMUST00000116755 | 120 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm26253-201 | ENSMUST00000122493 | 103 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm20305-201 | ENSMUST00000193226 | 177 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm22071-201 | ENSMUST00000116857 | 83 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25812-201 | ENSMUST00000082751 | 103 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25390-201 | ENSMUST00000157341 | 103 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Svbp-204 | ENSMUST00000210595 | 150 nt | TSL 5 BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25648-201 | ENSMUST00000177844 | 79 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm22951-201 | ENSMUST00000179471 | 107 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25740-201 | ENSMUST00000180247 | 107 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm44409-201 | ENSMUST00000198810 | 166 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm23315-201 | ENSMUST00000158003 | 109 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm22770-201 | ENSMUST00000158368 | 67 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm24996-201 | ENSMUST00000158390 | 99 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm26425-201 | ENSMUST00000122529 | 82 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25482-201 | ENSMUST00000083225 | 107 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Mir466-201 | ENSMUST00000093591 | 73 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm24750-201 | ENSMUST00000157843 | 104 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25779-201 | ENSMUST00000116710 | 95 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm25183-201 | ENSMUST00000157752 | 106 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm24495-201 | ENSMUST00000178575 | 79 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm22253-201 | ENSMUST00000179870 | 79 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Mir7231-201 | ENSMUST00000196252 | 61 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Snord47-201 | ENSMUST00000083034 | 77 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm23044-201 | ENSMUST00000157891 | 100 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm26257-201 | ENSMUST00000122500 | 107 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Gm23649-201 | ENSMUST00000179007 | 107 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Syne1 | Q6ZWR6 | Snord70-201 | ENSMUST00000104157 | 87 nt | BASIC | -0,71 | □□□□□ -2,52 | | |
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms