Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
Zfp558E9Q1J0 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
Zfp558E9Q1J0 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
Zfp558E9Q1J0 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
Zfp558E9Q1J0 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
Zfp558E9Q1J0 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Zfp558E9Q1J0 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Zfp558E9Q1J0 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Zfp558E9Q1J0 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Zfp558E9Q1J0 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Zfp558E9Q1J0 Mir7218-201ENSMUST00000200050 59 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
Zfp558E9Q1J0 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm22385-201ENSMUST00000158189 101 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm22717-201ENSMUST00000122703 171 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm25903-201ENSMUST00000158492 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Mir192-201ENSMUST00000083589 89 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm10663-201ENSMUST00000098716 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm23751-201ENSMUST00000157583 136 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm25326-201ENSMUST00000101903 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm23573-201ENSMUST00000104408 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Mir379-201ENSMUST00000083564 66 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm24097-201ENSMUST00000178720 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Gm44347-201ENSMUST00000199602 108 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
Zfp558E9Q1J0 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.98□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm23688-201ENSMUST00000178502 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm23944-201ENSMUST00000178607 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm26283-201ENSMUST00000178625 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm25452-201ENSMUST00000178776 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm23286-201ENSMUST00000178963 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm22640-201ENSMUST00000179035 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm25984-201ENSMUST00000179129 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm25585-201ENSMUST00000179469 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm26374-201ENSMUST00000179737 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm24040-201ENSMUST00000179786 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm25017-201ENSMUST00000179805 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm23618-201ENSMUST00000179912 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm26284-201ENSMUST00000180107 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm24570-201ENSMUST00000180314 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm24654-201ENSMUST00000180315 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Mir539-201ENSMUST00000102109 74 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm22602-201ENSMUST00000157596 95 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm23811-201ENSMUST00000175155 84 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm22357-201ENSMUST00000082882 83 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm23421-201ENSMUST00000158934 104 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Mir28c-201ENSMUST00000200096 75 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm25023-201ENSMUST00000082977 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Zfp558E9Q1J0 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Zfp558E9Q1J0 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Zfp558E9Q1J0 Gm22746-201ENSMUST00000082494 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Zfp558E9Q1J0 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Zfp558E9Q1J0 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
Zfp558E9Q1J0 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
Zfp558E9Q1J0 Gm24806-201ENSMUST00000117036 90 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
Zfp558E9Q1J0 Svbp-204ENSMUST00000210595 150 ntTSL 5 BASIC-2.05□□□□□ -2.74
Zfp558E9Q1J0 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
Zfp558E9Q1J0 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
Zfp558E9Q1J0 Gm44351-201ENSMUST00000200090 95 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
Zfp558E9Q1J0 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
Zfp558E9Q1J0 AC238676.2-201ENSMUST00000220910 94 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
Zfp558E9Q1J0 Gm23992-201ENSMUST00000174981 67 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
Zfp558E9Q1J0 Traj29-201ENSMUST00000103712 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.11□□□□□ -2.75
Zfp558E9Q1J0 Mir466q-201ENSMUST00000175249 76 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
Zfp558E9Q1J0 Gm43206-201ENSMUST00000197990 114 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
Zfp558E9Q1J0 Gm44377-201ENSMUST00000199039 87 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
Zfp558E9Q1J0 Mir295-201ENSMUST00000104694 69 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
Zfp558E9Q1J0 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
Zfp558E9Q1J0 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-2.13□□□□□ -2.75
Zfp558E9Q1J0 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
Zfp558E9Q1J0 Gm26122-201ENSMUST00000083362 82 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
Zfp558E9Q1J0 Mir297a-3-201ENSMUST00000103768 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
Zfp558E9Q1J0 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.9 ms