Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm25524-201ENSMUST00000101821 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rnft1Q9DCN7 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm22401-201ENSMUST00000174927 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm22746-201ENSMUST00000082494 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rnft1Q9DCN7 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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Rnft1Q9DCN7 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rnft1Q9DCN7 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Rnft1Q9DCN7 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Rnft1Q9DCN7 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Rnft1Q9DCN7 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Rnft1Q9DCN7 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Rnft1Q9DCN7 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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Rnft1Q9DCN7 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Rnft1Q9DCN7 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Rnft1Q9DCN7 Mir7651-201ENSMUST00000184154 64 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Rnft1Q9DCN7 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Rnft1Q9DCN7 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Rnft1Q9DCN7 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Rnft1Q9DCN7 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
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Rnft1Q9DCN7 Gm27749-201ENSMUST00000183651 125 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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Rnft1Q9DCN7 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Rnft1Q9DCN7 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Rnft1Q9DCN7 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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Rnft1Q9DCN7 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Rnft1Q9DCN7 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rnft1Q9DCN7 Gm23573-201ENSMUST00000104408 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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Rnft1Q9DCN7 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Rnft1Q9DCN7 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Rnft1Q9DCN7 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Rnft1Q9DCN7 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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