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Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7
Sgo1, Shugoshin 1, mouse
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Sgo1
Q9CXH7
Gm23244-201
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92 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
Sgo1
Q9CXH7
Gm24070-201
ENSMUST00000104519
130 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
Sgo1
Q9CXH7
Gm27610-201
ENSMUST00000184026
74 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
Sgo1
Q9CXH7
AC160962.3-201
ENSMUST00000225914
112 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
Sgo1
Q9CXH7
Gm25322-201
ENSMUST00000122556
104 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
Sgo1
Q9CXH7
Mir3101-201
ENSMUST00000175607
88 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
Sgo1
Q9CXH7
Gm24381-201
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104 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Gm22165-201
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103 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Gm27263-201
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76 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Gm22827-201
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BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Gm24162-201
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102 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Gm25609-201
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104 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
n-R5s8-201
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118 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Mir717-201
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BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Gm24377-201
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131 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Gm22234-201
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65 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Gm44385-201
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81 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Gm25964-201
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BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Mir145b-201
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75 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Gm25815-201
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107 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Snord45b-201
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71 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Mir18b-201
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83 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Gm22489-201
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62 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Gm25108-201
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78 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
Sgo1
Q9CXH7
Gm24372-201
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110 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Gm24296-201
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BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Mir7043-201
ENSMUST00000184219
70 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Mir5124b-201
ENSMUST00000184251
85 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Gm6293-201
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195 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Mir574-201
ENSMUST00000103854
78 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Gm22813-202
ENSMUST00000200346
124 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Gm25987-201
ENSMUST00000083234
107 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Gm25641-201
ENSMUST00000175135
108 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Gm22413-201
ENSMUST00000175465
85 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Gm23468-201
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108 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Gm23017-201
ENSMUST00000177583
72 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Gm25798-201
ENSMUST00000082641
107 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Gm27977-201
ENSMUST00000185159
111 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Gm44311-201
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69 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Sgo1
Q9CXH7
Gm24336-201
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146 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Sgo1
Q9CXH7
Gm27554-201
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98 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sgo1
Q9CXH7
Gm25431-201
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BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Sgo1
Q9CXH7
Mir466f-1-201
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BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Sgo1
Q9CXH7
Gm25440-201
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154 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Sgo1
Q9CXH7
Gm24971-201
ENSMUST00000175581
110 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
Sgo1
Q9CXH7
Gm24586-201
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89 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sgo1
Q9CXH7
AC158537.2-201
ENSMUST00000223575
150 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sgo1
Q9CXH7
Gm24482-201
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93 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Sgo1
Q9CXH7
Gm24650-201
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103 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Sgo1
Q9CXH7
CT030166.3-201
ENSMUST00000223203
193 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Sgo1
Q9CXH7
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107 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Sgo1
Q9CXH7
Gm22335-201
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BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm24199-201
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BASIC
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□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm26499-201
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BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm26096-201
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79 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm22354-201
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BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm23831-201
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85 nt
BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm22938-201
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BASIC
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□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm26233-201
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70 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm22298-201
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133 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
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BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm25542-201
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94 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm24714-201
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101 nt
BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm37832-201
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BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Cyp2j7-ps1-201
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173 nt
BASIC
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□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm22595-201
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130 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm21830-201
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APPRIS P1
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Mir677-202
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BASIC
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□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm24201-201
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BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
Sgo1
Q9CXH7
Gm22729-201
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129 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Mir7094-2-201
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BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Mir7094-1-201
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60 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Gm24410-201
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107 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Mir450b-201
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BASIC
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□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
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BASIC
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□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Gm27415-201
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BASIC
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□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
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110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Gm25854-201
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BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Gm23955-201
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100 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Gm27784-201
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113 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
AC154832.1-201
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BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Gm24400-201
ENSMUST00000157865
107 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Gm22013-201
ENSMUST00000158788
103 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Gm24108-201
ENSMUST00000175495
77 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Gm23306-201
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105 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Gm25879-201
ENSMUST00000104330
107 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Gm25061-201
ENSMUST00000104665
107 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Gm22845-201
ENSMUST00000157712
104 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Mir6961-201
ENSMUST00000183874
67 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
Sgo1
Q9CXH7
Gm23072-201
ENSMUST00000158243
123 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
Gm42773-201
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148 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
Gm24704-201
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107 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
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BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
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104 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
Gm29344-201
ENSMUST00000068143
210 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
Gm11084-201
ENSMUST00000112062
69 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
Gm23812-201
ENSMUST00000175156
84 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
Gm23374-201
ENSMUST00000175408
84 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
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ENSMUST00000180247
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BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
Sgo1
Q9CXH7
Mir302c-201
ENSMUST00000083548
68 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
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