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Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8
Casc1, Protein CASC1, mouse
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Casc1
Q6TDU8
Gm26283-201
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-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm25452-201
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79 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm23286-201
ENSMUST00000178963
79 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm22640-201
ENSMUST00000179035
79 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm25984-201
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79 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm25585-201
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79 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm26374-201
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79 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm24040-201
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-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
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□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm24654-201
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□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
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□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
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□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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-1.2
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm24162-201
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BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm24167-201
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124 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm24028-201
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BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm27554-201
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98 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm2077-201
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BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm25798-201
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107 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm22298-201
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133 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm23790-201
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107 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm25248-201
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98 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Gm26466-201
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BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Gm26441-201
ENSMUST00000082590
104 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Gm22305-201
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108 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Gm22004-201
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107 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Gm10563-201
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APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Mir302c-201
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68 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Gm23966-201
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107 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Snora2b-201
ENSMUST00000084005
137 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Mir1948-201
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85 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Gm24108-201
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BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Gm44589-201
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BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Gm24704-201
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BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Mir702-201
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BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Gm23904-201
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BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
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67 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Mir7057-201
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BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Gm24705-201
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Gm23349-201
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98 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
Gm23678-201
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107 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Casc1
Q6TDU8
Gm24400-201
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107 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
Casc1
Q6TDU8
Gm23308-201
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107 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
Casc1
Q6TDU8
Gm23173-201
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Casc1
Q6TDU8
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□□□□□ -2.62
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Casc1
Q6TDU8
Gm22013-201
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BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
Casc1
Q6TDU8
Gm21830-201
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APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
Casc1
Q6TDU8
Mir1839-201
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127 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
Casc1
Q6TDU8
Gm26499-201
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BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
Casc1
Q6TDU8
Gm26096-201
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79 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
Casc1
Q6TDU8
Gm25712-201
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Casc1
Q6TDU8
Gm24701-201
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BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
Mir3083-201
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BASIC
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□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
Gm27798-201
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BASIC
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□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
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□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
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□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
Gm24091-201
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BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
Gm23711-201
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83 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
Snord16a-201
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BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
Gm11084-201
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69 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
Gm23590-201
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104 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
Gm23812-201
ENSMUST00000175156
84 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
Gm23374-201
ENSMUST00000175408
84 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
9230110F11Rik-202
ENSMUST00000212907
191 nt
TSL 5
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
Gm25289-201
ENSMUST00000122799
119 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
Gm23166-201
ENSMUST00000157164
101 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
AC154832.1-201
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BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
Gm23244-201
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BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
Casc1
Q6TDU8
Gm23240-201
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121 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
Casc1
Q6TDU8
Gm24605-201
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96 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
Casc1
Q6TDU8
Gm23199-201
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107 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
Casc1
Q6TDU8
Mir6957-201
ENSMUST00000183708
64 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
Casc1
Q6TDU8
Gm25417-201
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131 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
Casc1
Q6TDU8
Mir876-201
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81 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
Casc1
Q6TDU8
Gm25542-201
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94 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
Casc1
Q6TDU8
Gm29344-201
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BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
Casc1
Q6TDU8
Gm24946-201
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106 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
Casc1
Q6TDU8
Gm23630-201
ENSMUST00000175292
104 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
Casc1
Q6TDU8
AC160962.3-201
ENSMUST00000225914
112 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
Casc1
Q6TDU8
mt-Ts1-201
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69 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
Casc1
Q6TDU8
Gm24234-201
ENSMUST00000104316
107 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
Casc1
Q6TDU8
Gm23306-201
ENSMUST00000179058
105 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
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