Protein–RNA interactions for Protein: Q61056
Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Trpc1 | Q61056 | AC167019.1-201 | ENSMUST00000227913 | 106 nt | BASIC | -0,55 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22828-201 | ENSMUST00000083768 | 107 nt | BASIC | -0,55 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25440-201 | ENSMUST00000158279 | 154 nt | BASIC | -0,56 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22157-201 | ENSMUST00000158410 | 104 nt | BASIC | -0,56 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir378c-201 | ENSMUST00000184478 | 99 nt | BASIC | -0,56 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Snord49b-201 | ENSMUST00000082503 | 72 nt | BASIC | -0,56 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mirlet7d-201 | ENSMUST00000083519 | 103 nt | BASIC | -0,56 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir450b-201 | ENSMUST00000102095 | 82 nt | BASIC | -0,57 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm45688-201 | ENSMUST00000210002 | 101 nt | BASIC | -0,57 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25596-201 | ENSMUST00000178368 | 107 nt | BASIC | -0,58 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25798-201 | ENSMUST00000082641 | 107 nt | BASIC | -0,58 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25137-201 | ENSMUST00000083251 | 110 nt | BASIC | -0,58 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25472-201 | ENSMUST00000175454 | 78 nt | BASIC | -0,59 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm27977-201 | ENSMUST00000185159 | 111 nt | BASIC | -0,59 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22827-201 | ENSMUST00000083766 | 107 nt | BASIC | -0,59 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22354-201 | ENSMUST00000083919 | 70 nt | BASIC | -0,59 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm37832-201 | ENSMUST00000118935 | 189 nt | BASIC | -0,6 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25388-201 | ENSMUST00000157339 | 151 nt | BASIC | -0,6 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22845-201 | ENSMUST00000157712 | 104 nt | BASIC | -0,6 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir183-201 | ENSMUST00000083685 | 70 nt | BASIC | -0,6 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm26499-201 | ENSMUST00000178544 | 79 nt | BASIC | -0,61 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm26096-201 | ENSMUST00000179084 | 79 nt | BASIC | -0,61 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm27735-201 | ENSMUST00000185085 | 76 nt | BASIC | -0,61 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | AC158537.2-201 | ENSMUST00000223575 | 150 nt | BASIC | -0,61 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24336-201 | ENSMUST00000104203 | 146 nt | BASIC | -0,62 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24381-201 | ENSMUST00000122697 | 104 nt | BASIC | -0,62 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24650-201 | ENSMUST00000157105 | 103 nt | BASIC | -0,62 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25879-201 | ENSMUST00000104330 | 107 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22298-201 | ENSMUST00000082662 | 133 nt | BASIC | -0,63 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25542-201 | ENSMUST00000116889 | 94 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25740-201 | ENSMUST00000180247 | 107 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22458-201 | ENSMUST00000082576 | 107 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir103-1-201 | ENSMUST00000083619 | 86 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir96-201 | ENSMUST00000083652 | 106 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir18b-201 | ENSMUST00000103923 | 83 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir7094-2-201 | ENSMUST00000184622 | 60 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir7094-1-201 | ENSMUST00000199671 | 60 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24410-201 | ENSMUST00000083433 | 107 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25641-201 | ENSMUST00000175135 | 108 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm27554-201 | ENSMUST00000185074 | 98 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir344h-1-201 | ENSMUST00000174922 | 60 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24971-201 | ENSMUST00000175581 | 110 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir344h-2-201 | ENSMUST00000175612 | 60 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23306-201 | ENSMUST00000179058 | 105 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm27884-201 | ENSMUST00000183865 | 76 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23955-201 | ENSMUST00000157214 | 100 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm27784-201 | ENSMUST00000184926 | 113 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir148a-201 | ENSMUST00000083571 | 99 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23607-201 | ENSMUST00000104550 | 126 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22729-201 | ENSMUST00000158088 | 129 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm6293-201 | ENSMUST00000050339 | 195 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Cyp2j7-ps1-201 | ENSMUST00000122430 | 173 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25061-201 | ENSMUST00000104665 | 107 nt | BASIC | -0,71 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23197-201 | ENSMUST00000158809 | 112 nt | BASIC | -0,71 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm11333-201 | ENSMUST00000119479 | 148 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir669m-1-201 | ENSMUST00000158945 | 98 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm21836-201 | ENSMUST00000178787 | 63 nt | APPRIS P1 BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25644-201 | ENSMUST00000083209 | 107 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25417-201 | ENSMUST00000104212 | 131 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25854-201 | ENSMUST00000082792 | 72 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25108-201 | ENSMUST00000122473 | 78 nt | BASIC | -0,74 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm27610-201 | ENSMUST00000184026 | 74 nt | BASIC | -0,74 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22595-201 | ENSMUST00000104250 | 130 nt | BASIC | -0,75 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23652-201 | ENSMUST00000116752 | 107 nt | BASIC | -0,75 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24400-201 | ENSMUST00000157865 | 107 nt | BASIC | -0,75 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24946-201 | ENSMUST00000158332 | 106 nt | BASIC | -0,75 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm26233-201 | ENSMUST00000175530 | 70 nt | BASIC | -0,75 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24714-201 | ENSMUST00000102382 | 101 nt | BASIC | -0,76 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | n-R5s8-201 | ENSMUST00000104121 | 118 nt | BASIC | -0,76 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24482-201 | ENSMUST00000117005 | 93 nt | BASIC | -0,76 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Trgj1-201 | ENSMUST00000200495 | 60 nt | APPRIS P1 BASIC | -0,76 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22454-201 | ENSMUST00000082583 | 107 nt | BASIC | -0,76 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22234-201 | ENSMUST00000174906 | 65 nt | BASIC | -0,77 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm44481-201 | ENSMUST00000197288 | 84 nt | BASIC | -0,77 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm44339-201 | ENSMUST00000200598 | 84 nt | BASIC | -0,77 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm27415-201 | ENSMUST00000183720 | 95 nt | BASIC | -0,78 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm42773-201 | ENSMUST00000196962 | 148 nt | BASIC | -0,78 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir136-201 | ENSMUST00000199494 | 62 nt | BASIC | -0,78 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23570-201 | ENSMUST00000083029 | 104 nt | BASIC | -0,78 | □□□□□ -2,53 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir702-201 | ENSMUST00000102285 | 109 nt | BASIC | -0,79 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24372-201 | ENSMUST00000104400 | 110 nt | BASIC | -0,79 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir574-201 | ENSMUST00000103854 | 78 nt | BASIC | -0,8 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22489-201 | ENSMUST00000116813 | 62 nt | BASIC | -0,8 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir145b-201 | ENSMUST00000184434 | 75 nt | BASIC | -0,8 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm44311-201 | ENSMUST00000196448 | 69 nt | BASIC | -0,8 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22305-201 | ENSMUST00000082690 | 108 nt | BASIC | -0,8 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23240-201 | ENSMUST00000083009 | 121 nt | BASIC | -0,8 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir15b-201 | ENSMUST00000083646 | 64 nt | BASIC | -0,8 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24988-201 | ENSMUST00000104460 | 121 nt | BASIC | -0,81 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22429-201 | ENSMUST00000158553 | 130 nt | BASIC | -0,81 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir7043-201 | ENSMUST00000184219 | 70 nt | BASIC | -0,81 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir5124b-201 | ENSMUST00000184251 | 85 nt | BASIC | -0,81 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir677-202 | ENSMUST00000197076 | 78 nt | BASIC | -0,81 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23173-201 | ENSMUST00000157161 | 160 nt | BASIC | -0,82 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir1948-201 | ENSMUST00000157325 | 85 nt | BASIC | -0,82 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir3101-201 | ENSMUST00000175607 | 88 nt | BASIC | -0,82 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | CT030166.3-201 | ENSMUST00000223203 | 193 nt | BASIC | -0,82 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm19248-201 | ENSMUST00000209404 | 110 nt | BASIC | -0,83 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm11084-201 | ENSMUST00000112062 | 69 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24296-201 | ENSMUST00000158297 | 106 nt | BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
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