Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm23573-201ENSMUST00000104408 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm23961-201ENSMUST00000104685 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm25222-201ENSMUST00000158199 126 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm27554-201ENSMUST00000185074 98 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trim71Q1PSW8 Snord67-201ENSMUST00000104033 111 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm24377-201ENSMUST00000104398 131 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm26257-201ENSMUST00000122500 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm23787-201ENSMUST00000122538 73 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm26139-201ENSMUST00000180098 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm22357-201ENSMUST00000082882 83 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm25648-201ENSMUST00000177844 79 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 AC161271.1-201ENSMUST00000226914 150 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm25326-201ENSMUST00000101903 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Trim71Q1PSW8 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm27784-201ENSMUST00000184926 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm22746-201ENSMUST00000082494 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm22717-201ENSMUST00000122703 171 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm25779-201ENSMUST00000116710 95 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm22197-201ENSMUST00000116866 58 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm25465-201ENSMUST00000157716 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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