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Protein–RNA interactions for Protein: O35126
Atn1, Atrophin-1, mouse
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1,175 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Atn1
O35126
Snora62-201
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149 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
Atn1
O35126
Mir196a-2-201
ENSMUST00000083554
85 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
Atn1
O35126
Mir15b-201
ENSMUST00000083646
64 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
Atn1
O35126
Gm25186-201
ENSMUST00000083909
108 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
Atn1
O35126
Mir717-201
ENSMUST00000102259
109 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Atn1
O35126
Gm22340-201
ENSMUST00000157717
114 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Atn1
O35126
Mir6896-201
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73 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Atn1
O35126
Gm24201-201
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125 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Atn1
O35126
Gm22067-201
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107 nt
BASIC
0.15
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
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BASIC
0.15
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm11966-201
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87 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm25952-201
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BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm24445-201
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107 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm25375-201
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BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm22540-201
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BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm23761-201
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104 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm24400-201
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BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm23159-201
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BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm23017-201
ENSMUST00000177583
72 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Mir3967-201
ENSMUST00000198710
68 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Mir494-201
ENSMUST00000093632
85 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm22595-201
ENSMUST00000104250
130 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm11084-201
ENSMUST00000112062
69 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm23785-201
ENSMUST00000116741
96 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm23590-201
ENSMUST00000157661
104 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm23856-201
ENSMUST00000158380
99 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm24331-201
ENSMUST00000175099
67 nt
BASIC
0.1
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm23801-201
ENSMUST00000175561
67 nt
BASIC
0.1
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm24485-201
ENSMUST00000178283
67 nt
BASIC
0.1
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm6358-201
ENSMUST00000089101
156 nt
APPRIS ALT2
BASIC
0.1
□□□□□ -2.39
Atn1
O35126
Gm23531-201
ENSMUST00000104567
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BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Gm22088-201
ENSMUST00000158341
117 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Mir7651-201
ENSMUST00000184154
64 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
CT030170.1-201
ENSMUST00000222183
148 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Gm25847-201
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96 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Gm23180-201
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125 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Gm23442-201
ENSMUST00000082919
134 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Snord85-201
ENSMUST00000083262
73 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Gm23237-201
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92 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Gm23994-201
ENSMUST00000158059
88 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Mir344-2-201
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BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Gm27607-201
ENSMUST00000185162
122 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Gm38208-201
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114 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Gm22368-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
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BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Gm26257-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Gm26491-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Gm23278-201
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143 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Mir5124a-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Gm22298-201
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BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Gm25703-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Atn1
O35126
Mir669f-201
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BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm22717-201
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BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm23826-201
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BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm22327-201
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BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm27749-201
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BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm44375-201
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150 nt
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm23649-201
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107 nt
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm25552-201
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BASIC
0
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Mir382-201
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BASIC
0
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm24467-201
ENSMUST00000157887
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BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm23072-201
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BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm25648-201
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BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Mir7231-201
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BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Mir327-201
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69 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
AC238676.2-201
ENSMUST00000220910
94 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm29344-201
ENSMUST00000068143
210 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Traj35-201
ENSMUST00000103706
65 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm25885-201
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109 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm24903-201
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126 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm25497-201
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132 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm22048-201
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89 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm22077-201
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BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm25183-201
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106 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm26210-201
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91 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm25354-201
ENSMUST00000179110
105 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm24218-201
ENSMUST00000180163
105 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Gm45374-201
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136 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
AC157278.1-201
ENSMUST00000221621
148 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Snord57-201
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72 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Atn1
O35126
Mir672-201
ENSMUST00000102331
100 nt
BASIC
-0.04
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
AL845349.1-201
ENSMUST00000213794
78 nt
BASIC
-0.04
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Gm23955-201
ENSMUST00000157214
100 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Gm22813-201
ENSMUST00000199948
123 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Gm25802-201
ENSMUST00000082639
77 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Gm24612-201
ENSMUST00000083267
107 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Gm24927-201
ENSMUST00000083397
107 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Mir142b-201
ENSMUST00000083486
115 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Gm23749-201
ENSMUST00000104223
131 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Gm27450-201
ENSMUST00000104632
90 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Gm22962-201
ENSMUST00000157962
73 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Gm24256-201
ENSMUST00000083696
84 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Gm24793-201
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132 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Gm24226-201
ENSMUST00000158826
97 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Mir487b-201
ENSMUST00000102265
82 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Gm11116-201
ENSMUST00000113257
54 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Gm22157-201
ENSMUST00000158410
104 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
Gm45741-201
ENSMUST00000212661
152 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
Atn1
O35126
n-R5s42-201
ENSMUST00000082697
104 nt
BASIC
-0.1
□□□□□ -2.43
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