Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Gm3893E9Q1I1 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Gm3893E9Q1I1 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Gm3893E9Q1I1 Gm27554-201ENSMUST00000185074 98 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm23817-201ENSMUST00000158449 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Gm3893E9Q1I1 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm3893E9Q1I1 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm3893E9Q1I1 Gm27749-201ENSMUST00000183651 125 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm3893E9Q1I1 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Gm3893E9Q1I1 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Gm3893E9Q1I1 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Gm3893E9Q1I1 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Gm3893E9Q1I1 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Gm3893E9Q1I1 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Gm3893E9Q1I1 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Gm3893E9Q1I1 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Gm3893E9Q1I1 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Gm3893E9Q1I1 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Gm3893E9Q1I1 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Gm3893E9Q1I1 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Gm3893E9Q1I1 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Gm3893E9Q1I1 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Gm3893E9Q1I1 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
Gm3893E9Q1I1 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Gm3893E9Q1I1 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Gm3893E9Q1I1 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Gm3893E9Q1I1 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Gm3893E9Q1I1 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Gm3893E9Q1I1 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Gm3893E9Q1I1 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Gm3893E9Q1I1 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Gm3893E9Q1I1 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm24377-201ENSMUST00000104398 131 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Gm3893E9Q1I1 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Svbp-204ENSMUST00000210595 150 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Gm3893E9Q1I1 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Gm3893E9Q1I1 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Gm3893E9Q1I1 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Gm3893E9Q1I1 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Gm3893E9Q1I1 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.8 ms