Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.85□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44377-201ENSMUST00000199039 87 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir192-201ENSMUST00000083589 89 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24806-201ENSMUST00000117036 90 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37646-201ENSMUST00000191756 111 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22357-201ENSMUST00000082882 83 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir539-201ENSMUST00000102109 74 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj29-201ENSMUST00000103712 60 ntAPPRIS P1 BASIC-3.95□□□□□ -3.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10663-201ENSMUST00000098716 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-3.97□□□□□ -3.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23688-201ENSMUST00000178502 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23944-201ENSMUST00000178607 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26283-201ENSMUST00000178625 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25452-201ENSMUST00000178776 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23286-201ENSMUST00000178963 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22640-201ENSMUST00000179035 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25984-201ENSMUST00000179129 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25585-201ENSMUST00000179469 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26374-201ENSMUST00000179737 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24040-201ENSMUST00000179786 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25017-201ENSMUST00000179805 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23618-201ENSMUST00000179912 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26284-201ENSMUST00000180107 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24570-201ENSMUST00000180314 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24654-201ENSMUST00000180315 79 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22566-201ENSMUST00000175541 85 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23637-201ENSMUST00000175075 94 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22602-201ENSMUST00000157596 95 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44347-201ENSMUST00000199602 108 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26122-201ENSMUST00000083362 82 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23811-201ENSMUST00000175155 84 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC-4.11□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir297a-3-201ENSMUST00000103768 102 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22183-201ENSMUST00000175420 73 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25903-201ENSMUST00000158492 103 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24097-201ENSMUST00000178720 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466o-201ENSMUST00000104832 84 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir28c-201ENSMUST00000200096 75 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms