Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 AC154832.1-201ENSMUST00000228928 141 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm26233-201ENSMUST00000175530 70 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm21830-201ENSMUST00000178898 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Mir7094-2-201ENSMUST00000184622 60 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm27784-201ENSMUST00000184926 113 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Mir7094-1-201ENSMUST00000199671 60 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm25431-201ENSMUST00000101978 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm27944-201ENSMUST00000185155 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm24091-201ENSMUST00000082550 83 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Gm23711-201ENSMUST00000083856 83 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CtcflA2APF3 Cyp2j7-ps1-201ENSMUST00000122430 173 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm42773-201ENSMUST00000196962 148 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm24704-201ENSMUST00000093715 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Mir677-202ENSMUST00000197076 78 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm26131-201ENSMUST00000082725 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Mir6961-201ENSMUST00000183874 67 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CtcflA2APF3 Mirlet7a-2-201ENSMUST00000175029 96 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm22335-201ENSMUST00000157724 99 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Mir136-201ENSMUST00000199494 62 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Mir6964-201ENSMUST00000200252 59 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm19248-201ENSMUST00000209404 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm23216-201ENSMUST00000179545 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm22305-201ENSMUST00000082690 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm25225-201ENSMUST00000158197 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm27554-201ENSMUST00000185074 98 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm23613-201ENSMUST00000082596 87 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CtcflA2APF3 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm26043-201ENSMUST00000116912 91 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm24047-201ENSMUST00000102405 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Mir466m-201ENSMUST00000175052 84 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Mir7057-201ENSMUST00000184685 58 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm44589-201ENSMUST00000207025 115 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm25712-201ENSMUST00000158634 93 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Gm23308-201ENSMUST00000179475 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CtcflA2APF3 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
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