Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
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Rnft1Q9DCN7 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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Rnft1Q9DCN7 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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Rnft1Q9DCN7 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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Rnft1Q9DCN7 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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Rnft1Q9DCN7 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rnft1Q9DCN7 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Rnft1Q9DCN7 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Rnft1Q9DCN7 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Rnft1Q9DCN7 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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Rnft1Q9DCN7 Snord67-201ENSMUST00000104033 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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Rnft1Q9DCN7 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Rnft1Q9DCN7 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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