Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sgo1Q9CXH7 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
Sgo1Q9CXH7 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Sgo1Q9CXH7 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Sgo1Q9CXH7 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Sgo1Q9CXH7 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sgo1Q9CXH7 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sgo1Q9CXH7 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sgo1Q9CXH7 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sgo1Q9CXH7 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sgo1Q9CXH7 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm27749-201ENSMUST00000183651 125 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Sgo1Q9CXH7 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Sgo1Q9CXH7 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Sgo1Q9CXH7 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Sgo1Q9CXH7 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Sgo1Q9CXH7 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Sgo1Q9CXH7 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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Sgo1Q9CXH7 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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Sgo1Q9CXH7 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
Sgo1Q9CXH7 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Sgo1Q9CXH7 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Sgo1Q9CXH7 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Sgo1Q9CXH7 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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Sgo1Q9CXH7 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
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Sgo1Q9CXH7 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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Sgo1Q9CXH7 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Sgo1Q9CXH7 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Sgo1Q9CXH7 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Sgo1Q9CXH7 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Sgo1Q9CXH7 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Sgo1Q9CXH7 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Sgo1Q9CXH7 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sgo1Q9CXH7 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sgo1Q9CXH7 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sgo1Q9CXH7 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sgo1Q9CXH7 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Sgo1Q9CXH7 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sgo1Q9CXH7 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
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