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Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76
Nepn, Nephrocan, mouse
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Nepn
Q9CQ76
Gm45125-201
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151 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm26225-201
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135 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm22305-201
ENSMUST00000082690
108 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm22335-201
ENSMUST00000157724
99 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm23308-201
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107 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm27937-201
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88 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Mir136-201
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62 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm44470-201
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142 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
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BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Mir297b-201
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109 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm25316-201
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118 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm22140-201
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120 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm23630-201
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104 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Mir1839-201
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127 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm22566-201
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85 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm24801-201
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105 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm26109-201
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70 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm24384-201
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75 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm44589-201
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115 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Vmn2r-ps50-201
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120 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Zfp813-ps-201
ENSMUST00000186652
2506 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm24701-201
ENSMUST00000101946
105 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm17522-202
ENSMUST00000186631
174 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm17412-202
ENSMUST00000189566
174 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
AC165138.1-201
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270 nt
BASIC
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□□□□□ -2.62
Nepn
Q9CQ76
Gm24070-201
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130 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Gm25315-201
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121 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Gm24183-201
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93 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
AC166341.8-201
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108 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Mir7-1-201
ENSMUST00000083500
108 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Gm26337-201
ENSMUST00000178000
79 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Gm43943-201
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113 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Gm24134-201
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71 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Gm22672-201
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134 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Gm23651-201
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120 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Gm25905-201
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101 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
AC132833.2-201
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157 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Traj43-201
ENSMUST00000103699
57 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
mt-Tt-201
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67 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Mir543-201
ENSMUST00000102286
76 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Gm23922-201
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79 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Gm24657-201
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BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Gm22996-201
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BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
mt-Td-201
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BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Gm22805-201
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BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
Nepn
Q9CQ76
Gm23852-201
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BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm27928-201
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BASIC
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□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
AC122335.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
mt-Ts1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm24201-201
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BASIC
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□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm23974-201
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131 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm22539-201
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BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
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136 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm23607-201
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126 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm11250-201
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306 nt
TSL 5
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm26262-201
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127 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm26468-201
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106 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm20108-201
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153 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm10351-201
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125 nt
BASIC
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□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm25619-201
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BASIC
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□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
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BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
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100 nt
BASIC
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□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Mir702-201
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BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm26104-201
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108 nt
BASIC
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□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Snord123-201
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BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm23751-201
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BASIC
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□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm25071-201
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BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Gm27686-201
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BASIC
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□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
Igkv13-78-1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.64
Nepn
Q9CQ76
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BASIC
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□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
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BASIC
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□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
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BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
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BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
Gm42844-201
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112 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
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BASIC
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□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
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BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
Mir5117-201
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BASIC
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□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
Olfr1041-ps1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
AC164561.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
Gm26454-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
Mir29b-1-201
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BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
Gm22205-201
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BASIC
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□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
Gm25440-201
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BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
Mir5619-201
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61 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
Gm27798-201
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BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
Nepn
Q9CQ76
Gm25964-201
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97 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
Nepn
Q9CQ76
Mir1948-201
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BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
Nepn
Q9CQ76
mt-Atp8-201
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204 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
Nepn
Q9CQ76
Gm26412-201
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BASIC
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□□□□□ -2.66
Nepn
Q9CQ76
Gm25653-201
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BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
Nepn
Q9CQ76
Gm44322-201
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115 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
Nepn
Q9CQ76
Traj33-201
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57 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
Nepn
Q9CQ76
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BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
Nepn
Q9CQ76
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BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Nepn
Q9CQ76
Gm23173-201
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160 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Nepn
Q9CQ76
Gm22770-201
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BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Nepn
Q9CQ76
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75 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Nepn
Q9CQ76
Gm25678-201
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73 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Nepn
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79 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
Nepn
Q9CQ76
Mir451b-201
ENSMUST00000196157
72 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
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