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Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8
Casc1, Protein CASC1, mouse
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Casc1
Q6TDU8
Gm24702-201
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-0.98
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm24206-201
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BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm24528-201
ENSMUST00000179164
79 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm22909-201
ENSMUST00000179190
79 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm26334-201
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79 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm25463-201
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79 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm25742-201
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BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
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Q6TDU8
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Q6TDU8
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Casc1
Q6TDU8
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□□□□□ -2.57
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Q6TDU8
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□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
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□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
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□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
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□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
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□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Mir5117-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm24134-201
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□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm43038-201
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-0.99
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm6293-201
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BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm24183-201
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93 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm22490-201
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119 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm24296-201
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106 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm23261-201
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136 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm22234-201
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BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm23017-201
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72 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Sult1c2-ps2-201
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276 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
mt-Tv-201
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BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Mir466-201
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73 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm22205-201
ENSMUST00000122655
71 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm27263-201
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BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm22165-201
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103 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm44311-201
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69 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm25684-201
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BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm25879-201
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107 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Mir145b-201
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75 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Gm22813-202
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124 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Casc1
Q6TDU8
Mir717-201
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BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Gm25915-201
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126 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Cyp2j7-ps1-201
ENSMUST00000122430
173 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Gm25619-201
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104 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Gm22770-201
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BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Gm22070-201
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BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Gm25696-201
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BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Gm25431-201
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107 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Mir7094-2-201
ENSMUST00000184622
60 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Mir7094-1-201
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60 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Gm17490-201
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63 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Gm27639-201
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BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Mir677-202
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78 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Gm23138-201
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103 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Gm23578-201
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104 nt
BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Gm22677-201
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BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Gm25229-201
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BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Gm25449-201
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BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Mir7043-201
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BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
Gm25920-201
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BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
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Casc1
Q6TDU8
Gm37832-201
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BASIC
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□□□□□ -2.59
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Q6TDU8
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BASIC
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Casc1
Q6TDU8
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BASIC
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□□□□□ -2.59
Casc1
Q6TDU8
Gm23350-201
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BASIC
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Q6TDU8
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BASIC
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Q6TDU8
Mir136-201
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BASIC
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Q6TDU8
Gm26456-201
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BASIC
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Casc1
Q6TDU8
Gm25609-201
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BASIC
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Casc1
Q6TDU8
Gm26425-201
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BASIC
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□□□□□ -2.59
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Q6TDU8
Zfp813-ps-201
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BASIC
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□□□□□ -2.59
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
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Casc1
Q6TDU8
Gm42773-201
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BASIC
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Casc1
Q6TDU8
mt-Tf-201
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BASIC
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Casc1
Q6TDU8
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BASIC
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□□□□□ -2.59
Casc1
Q6TDU8
Gm19248-201
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BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
Casc1
Q6TDU8
Mir466f-1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.59
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
-1.15
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Casc1
Q6TDU8
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BASIC
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Casc1
Q6TDU8
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BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm24714-201
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101 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm24199-201
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136 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm25440-201
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154 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm23831-201
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85 nt
BASIC
-1.17
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Casc1
Q6TDU8
Gm25641-201
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108 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm27415-201
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95 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm24201-201
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BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm25964-201
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BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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117 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm25225-201
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102 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
Gm24637-201
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85 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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-1.18
□□□□□ -2.6
Casc1
Q6TDU8
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BASIC
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Q6TDU8
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Casc1
Q6TDU8
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Casc1
Q6TDU8
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79 nt
BASIC
-1.18
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Casc1
Q6TDU8
Gm24021-201
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79 nt
BASIC
-1.18
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Casc1
Q6TDU8
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79 nt
BASIC
-1.18
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Casc1
Q6TDU8
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79 nt
BASIC
-1.18
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Q6TDU8
Gm23688-201
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BASIC
-1.18
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Casc1
Q6TDU8
Gm23944-201
ENSMUST00000178607
79 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
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