Protein–RNA interactions for Protein: Q61056
Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Trpc1 | Q61056 | Gm23056-201 | ENSMUST00000082803 | 111 nt | BASIC | -0,36 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23790-201 | ENSMUST00000083013 | 107 nt | BASIC | -0,36 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22677-201 | ENSMUST00000116977 | 108 nt | BASIC | -0,37 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24234-201 | ENSMUST00000104316 | 107 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25229-201 | ENSMUST00000178587 | 79 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24508-201 | ENSMUST00000180104 | 107 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm27749-201 | ENSMUST00000183651 | 125 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22459-201 | ENSMUST00000082577 | 108 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25991-201 | ENSMUST00000102439 | 99 nt | BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Traj38-201 | ENSMUST00000103704 | 62 nt | APPRIS P1 BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25149-201 | ENSMUST00000157119 | 82 nt | BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir5117-201 | ENSMUST00000083226 | 84 nt | BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24455-201 | ENSMUST00000083348 | 131 nt | BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24587-201 | ENSMUST00000116697 | 89 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25322-201 | ENSMUST00000122556 | 104 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22605-201 | ENSMUST00000158289 | 108 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22607-201 | ENSMUST00000158291 | 105 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | AC122327.1-201 | ENSMUST00000220778 | 108 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24148-201 | ENSMUST00000082762 | 80 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25987-201 | ENSMUST00000083234 | 107 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir23a-201 | ENSMUST00000083677 | 75 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir487b-201 | ENSMUST00000102265 | 82 nt | BASIC | -0,41 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25619-201 | ENSMUST00000122621 | 104 nt | BASIC | -0,41 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23314-201 | ENSMUST00000157218 | 107 nt | BASIC | -0,41 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25249-201 | ENSMUST00000175471 | 78 nt | BASIC | -0,41 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25449-201 | ENSMUST00000179389 | 79 nt | BASIC | -0,41 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25802-201 | ENSMUST00000082639 | 77 nt | BASIC | -0,41 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24134-201 | ENSMUST00000083361 | 71 nt | BASIC | -0,41 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm26081-201 | ENSMUST00000104068 | 132 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25964-201 | ENSMUST00000157171 | 97 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24637-201 | ENSMUST00000158674 | 85 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25870-201 | ENSMUST00000179845 | 79 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm27937-201 | ENSMUST00000183605 | 88 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm27639-201 | ENSMUST00000184937 | 85 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm45655-201 | ENSMUST00000211625 | 160 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | AC160962.3-201 | ENSMUST00000225914 | 112 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24887-201 | ENSMUST00000104386 | 108 nt | BASIC | -0,43 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24064-201 | ENSMUST00000157486 | 106 nt | BASIC | -0,43 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm39149-201 | ENSMUST00000210258 | 186 nt | TSL 5 BASIC | -0,43 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm26207-201 | ENSMUST00000082909 | 104 nt | BASIC | -0,43 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24162-201 | ENSMUST00000093665 | 102 nt | BASIC | -0,43 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm27975-201 | ENSMUST00000184400 | 101 nt | BASIC | -0,44 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm43038-201 | ENSMUST00000202359 | 88 nt | BASIC | -0,44 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23690-201 | ENSMUST00000083036 | 94 nt | BASIC | -0,44 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Snord45b-201 | ENSMUST00000082797 | 71 nt | BASIC | -0,45 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24918-201 | ENSMUST00000083022 | 130 nt | BASIC | -0,45 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Snora2b-201 | ENSMUST00000084005 | 137 nt | BASIC | -0,45 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23494-201 | ENSMUST00000116830 | 126 nt | BASIC | -0,46 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23017-201 | ENSMUST00000177583 | 72 nt | BASIC | -0,46 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm26466-201 | ENSMUST00000179615 | 79 nt | BASIC | -0,46 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Snora16a-202 | ENSMUST00000196061 | 137 nt | BASIC | -0,46 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm26456-201 | ENSMUST00000082831 | 111 nt | BASIC | -0,46 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Snora62-201 | ENSMUST00000082991 | 149 nt | BASIC | -0,46 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Snora16a-201 | ENSMUST00000083163 | 136 nt | BASIC | -0,46 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir145a-201 | ENSMUST00000083658 | 70 nt | BASIC | -0,46 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Snord42b-201 | ENSMUST00000083742 | 69 nt | BASIC | -0,46 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24593-201 | ENSMUST00000122507 | 106 nt | BASIC | -0,47 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23726-201 | ENSMUST00000178937 | 67 nt | BASIC | -0,47 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25696-201 | ENSMUST00000082900 | 105 nt | BASIC | -0,47 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23244-201 | ENSMUST00000083375 | 92 nt | BASIC | -0,47 | □□□□□ -2,48 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22165-201 | ENSMUST00000158414 | 103 nt | BASIC | -0,48 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25772-201 | ENSMUST00000158574 | 56 nt | BASIC | -0,48 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24823-201 | ENSMUST00000175092 | 91 nt | BASIC | -0,48 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24201-201 | ENSMUST00000082946 | 125 nt | BASIC | -0,48 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm11116-201 | ENSMUST00000113257 | 54 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25510-201 | ENSMUST00000116986 | 123 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25380-201 | ENSMUST00000175463 | 107 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24641-201 | ENSMUST00000178055 | 107 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25484-201 | ENSMUST00000178217 | 107 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm26138-201 | ENSMUST00000179236 | 107 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22821-201 | ENSMUST00000179288 | 107 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm44385-201 | ENSMUST00000198781 | 81 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25815-201 | ENSMUST00000082755 | 107 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23298-201 | ENSMUST00000083181 | 107 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24614-201 | ENSMUST00000083269 | 107 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22057-201 | ENSMUST00000083387 | 107 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25516-201 | ENSMUST00000083857 | 107 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24070-201 | ENSMUST00000104519 | 130 nt | BASIC | -0,5 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23468-201 | ENSMUST00000157125 | 108 nt | BASIC | -0,5 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23644-201 | ENSMUST00000157856 | 77 nt | BASIC | -0,5 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23349-201 | ENSMUST00000158432 | 98 nt | BASIC | -0,5 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm23369-201 | ENSMUST00000175406 | 105 nt | BASIC | -0,5 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm26441-201 | ENSMUST00000082590 | 104 nt | BASIC | -0,5 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir741-201 | ENSMUST00000103931 | 71 nt | BASIC | -0,52 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22213-201 | ENSMUST00000157564 | 119 nt | BASIC | -0,52 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir3083-201 | ENSMUST00000175377 | 64 nt | BASIC | -0,52 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm22413-201 | ENSMUST00000175465 | 85 nt | BASIC | -0,52 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm27263-201 | ENSMUST00000184760 | 76 nt | BASIC | -0,52 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25289-201 | ENSMUST00000122799 | 119 nt | BASIC | -0,53 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24199-201 | ENSMUST00000157808 | 136 nt | BASIC | -0,53 | □□□□□ -2,49 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir717-201 | ENSMUST00000102259 | 109 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25609-201 | ENSMUST00000104019 | 104 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24586-201 | ENSMUST00000116695 | 89 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Mir6904-201 | ENSMUST00000183443 | 67 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm45125-201 | ENSMUST00000206908 | 151 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | mt-Tl1-201 | ENSMUST00000082391 | 75 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24377-201 | ENSMUST00000104398 | 131 nt | BASIC | -0,55 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24868-201 | ENSMUST00000157265 | 136 nt | BASIC | -0,55 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm24077-201 | ENSMUST00000158183 | 136 nt | BASIC | -0,55 | □□□□□ -2,5 | | |
Trpc1 | Q61056 | Gm25010-201 | ENSMUST00000158403 | 65 nt | BASIC | -0,55 | □□□□□ -2,5 | | |
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