Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC0,38□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm11966-201ENSMUST00000119907 87 ntBASIC0,38□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC0,38□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC0,38□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC0,38□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC0,38□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC0,38□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC0,38□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC0,37□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0,37□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC0,37□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC0,37□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC0,37□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC0,37□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC0,37□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0,37□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC0,37□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC0,36□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC0,36□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC0,36□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC0,36□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC0,36□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC0,36□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC0,36□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0,36□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC0,36□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC0,35□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC0,35□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC0,35□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC0,35□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC0,35□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC0,35□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC0,35□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC0,35□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0,34□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC0,34□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC0,34□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0,34□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0,34□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC0,34□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC0,33□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0,33□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0,33□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC0,33□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC0,33□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Svbp-204ENSMUST00000210595 150 ntTSL 5 BASIC0,33□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC0,33□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC0,32□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0,32□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC0,32□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC0,32□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0,32□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC0,32□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC0,32□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0,32□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC0,31□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC0,31□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0,31□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC0,31□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC0,31□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC0,31□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC0,31□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC0,31□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC0,31□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC0,31□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC0,31□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC0,31□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0,3□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC0,3□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC0,3□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC0,3□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC0,3□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC0,3□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC0,3□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC0,3□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC0,3□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC0,3□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0,29□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC0,29□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0,29□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0,29□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC0,29□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0,29□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC0,28□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC0,28□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC0,28□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC0,28□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC0,28□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Gm25705-201ENSMUST00000083119 104 ntBASIC0,28□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC0,28□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC0,28□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC0,28□□□□□ -2,36
Trim71Q1PSW8 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC0,27□□□□□ -2,37
Trim71Q1PSW8 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC0,27□□□□□ -2,37
Trim71Q1PSW8 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC0,27□□□□□ -2,37
Trim71Q1PSW8 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC0,27□□□□□ -2,37
Trim71Q1PSW8 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC0,27□□□□□ -2,37
Trim71Q1PSW8 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC0,27□□□□□ -2,37
Trim71Q1PSW8 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC0,26□□□□□ -2,37
Trim71Q1PSW8 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC0,26□□□□□ -2,37
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