Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Sh3bp2Q06649 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Sh3bp2Q06649 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Sh3bp2Q06649 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Sh3bp2Q06649 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Sh3bp2Q06649 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Sh3bp2Q06649 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sh3bp2Q06649 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Sh3bp2Q06649 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sh3bp2Q06649 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sh3bp2Q06649 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sh3bp2Q06649 Gm22127-201ENSMUST00000083239 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sh3bp2Q06649 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Gm22357-201ENSMUST00000082882 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sh3bp2Q06649 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm24297-201ENSMUST00000158300 68 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sh3bp2Q06649 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm25779-201ENSMUST00000116710 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm23787-201ENSMUST00000122538 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sh3bp2Q06649 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Snord67-201ENSMUST00000104033 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sh3bp2Q06649 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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