Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38
Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Gm21972 | J3QN38 | Gm23345-201 | ENSMUST00000083817 | 150 nt | BASIC | -4,02 | □□□□□ -3,05 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm25716-201 | ENSMUST00000158628 | 104 nt | BASIC | -4,03 | □□□□□ -3,05 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm23337-201 | ENSMUST00000158959 | 118 nt | BASIC | -4,03 | □□□□□ -3,05 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm43977-201 | ENSMUST00000203970 | 189 nt | BASIC | -4,03 | □□□□□ -3,05 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm45002-201 | ENSMUST00000208045 | 120 nt | BASIC | -4,03 | □□□□□ -3,05 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm27579-201 | ENSMUST00000158113 | 63 nt | BASIC | -4,04 | □□□□□ -3,06 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm23141-201 | ENSMUST00000178682 | 94 nt | BASIC | -4,04 | □□□□□ -3,06 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm23306-201 | ENSMUST00000179058 | 105 nt | BASIC | -4,04 | □□□□□ -3,06 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm21961-201 | ENSMUST00000110100 | 114 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | -4,05 | □□□□□ -3,06 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm25887-201 | ENSMUST00000157777 | 84 nt | BASIC | -4,08 | □□□□□ -3,06 | | |
Gm21972 | J3QN38 | AC154245.1-201 | ENSMUST00000224615 | 601 nt | BASIC | -4,08 | □□□□□ -3,06 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm25390-201 | ENSMUST00000157341 | 103 nt | BASIC | -4,09 | □□□□□ -3,06 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm23817-201 | ENSMUST00000158449 | 104 nt | BASIC | -4,1 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Mir6237-201 | ENSMUST00000183808 | 91 nt | BASIC | -4,1 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22373-201 | ENSMUST00000104584 | 89 nt | BASIC | -4,11 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22139-201 | ENSMUST00000158747 | 105 nt | BASIC | -4,11 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Vmn2r-ps116-201 | ENSMUST00000175997 | 126 nt | BASIC | -4,11 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | AC109214.2-201 | ENSMUST00000220089 | 358 nt | BASIC | -4,11 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm23579-201 | ENSMUST00000158528 | 103 nt | BASIC | -4,12 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22458-201 | ENSMUST00000082576 | 107 nt | BASIC | -4,12 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Mir192-201 | ENSMUST00000083589 | 89 nt | BASIC | -4,12 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm24185-201 | ENSMUST00000122578 | 105 nt | BASIC | -4,13 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm25297-201 | ENSMUST00000175490 | 67 nt | BASIC | -4,13 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22196-201 | ENSMUST00000116865 | 109 nt | BASIC | -4,14 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm26097-201 | ENSMUST00000179642 | 93 nt | BASIC | -4,14 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm25854-201 | ENSMUST00000082792 | 72 nt | BASIC | -4,14 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm24801-201 | ENSMUST00000178503 | 105 nt | BASIC | -4,15 | □□□□□ -3,07 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Mir539-201 | ENSMUST00000102109 | 74 nt | BASIC | -4,16 | □□□□□ -3,08 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm25995-201 | ENSMUST00000175396 | 142 nt | BASIC | -4,16 | □□□□□ -3,08 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm24134-201 | ENSMUST00000083361 | 71 nt | BASIC | -4,16 | □□□□□ -3,08 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm23707-201 | ENSMUST00000104366 | 125 nt | BASIC | -4,17 | □□□□□ -3,08 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm24054-201 | ENSMUST00000158619 | 105 nt | BASIC | -4,17 | □□□□□ -3,08 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Snord78-201 | ENSMUST00000104032 | 66 nt | BASIC | -4,18 | □□□□□ -3,08 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm24211-201 | ENSMUST00000158264 | 107 nt | BASIC | -4,18 | □□□□□ -3,08 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm26401-201 | ENSMUST00000158502 | 76 nt | BASIC | -4,21 | □□□□□ -3,08 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm27995-201 | ENSMUST00000184402 | 100 nt | BASIC | -4,21 | □□□□□ -3,08 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Mir3970-201 | ENSMUST00000199287 | 90 nt | BASIC | -4,21 | □□□□□ -3,08 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm23003-201 | ENSMUST00000179948 | 107 nt | BASIC | -4,22 | □□□□□ -3,08 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm24947-201 | ENSMUST00000158334 | 110 nt | BASIC | -4,23 | □□□□□ -3,09 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Mir7670-201 | ENSMUST00000183689 | 69 nt | BASIC | -4,25 | □□□□□ -3,09 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm14838-201 | ENSMUST00000118913 | 248 nt | BASIC | -4,26 | □□□□□ -3,09 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm44409-201 | ENSMUST00000198810 | 166 nt | BASIC | -4,26 | □□□□□ -3,09 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm23730-201 | ENSMUST00000083236 | 107 nt | BASIC | -4,26 | □□□□□ -3,09 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm24492-201 | ENSMUST00000083798 | 107 nt | BASIC | -4,26 | □□□□□ -3,09 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm24384-201 | ENSMUST00000122693 | 75 nt | BASIC | -4,27 | □□□□□ -3,09 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Mir181a-2-201 | ENSMUST00000083489 | 76 nt | BASIC | -4,27 | □□□□□ -3,09 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Mir669p-2-201 | ENSMUST00000103868 | 87 nt | BASIC | -4,28 | □□□□□ -3,09 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Mir669p-1-201 | ENSMUST00000103884 | 87 nt | BASIC | -4,28 | □□□□□ -3,09 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm25644-201 | ENSMUST00000083209 | 107 nt | BASIC | -4,28 | □□□□□ -3,09 | | |
Gm21972 | J3QN38 | n-R5s155-201 | ENSMUST00000122531 | 113 nt | BASIC | -4,29 | □□□□□ -3,1 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm27465-201 | ENSMUST00000184290 | 91 nt | BASIC | -4,3 | □□□□□ -3,1 | | |
Gm21972 | J3QN38 | AC161271.1-201 | ENSMUST00000226914 | 150 nt | BASIC | -4,3 | □□□□□ -3,1 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22080-201 | ENSMUST00000157591 | 106 nt | BASIC | -4,31 | □□□□□ -3,1 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm43505-201 | ENSMUST00000200579 | 139 nt | BASIC | -4,31 | □□□□□ -3,1 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22491-201 | ENSMUST00000157190 | 102 nt | BASIC | -4,32 | □□□□□ -3,1 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22842-201 | ENSMUST00000157709 | 118 nt | BASIC | -4,33 | □□□□□ -3,1 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm26194-201 | ENSMUST00000175036 | 71 nt | BASIC | -4,33 | □□□□□ -3,1 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm25641-201 | ENSMUST00000175135 | 108 nt | BASIC | -4,33 | □□□□□ -3,1 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22259-201 | ENSMUST00000178926 | 107 nt | BASIC | -4,33 | □□□□□ -3,1 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22140-201 | ENSMUST00000158745 | 120 nt | BASIC | -4,34 | □□□□□ -3,1 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Snora2b-201 | ENSMUST00000084005 | 137 nt | BASIC | -4,34 | □□□□□ -3,1 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm25023-201 | ENSMUST00000082977 | 107 nt | BASIC | -4,35 | □□□□□ -3,11 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Mir741-201 | ENSMUST00000103931 | 71 nt | BASIC | -4,36 | □□□□□ -3,11 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm24263-201 | ENSMUST00000104059 | 107 nt | BASIC | -4,36 | □□□□□ -3,11 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm27928-201 | ENSMUST00000183747 | 256 nt | BASIC | -4,36 | □□□□□ -3,11 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm44373-201 | ENSMUST00000196112 | 169 nt | BASIC | -4,38 | □□□□□ -3,11 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22989-201 | ENSMUST00000158313 | 86 nt | BASIC | -4,39 | □□□□□ -3,11 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm44347-201 | ENSMUST00000199602 | 108 nt | BASIC | -4,39 | □□□□□ -3,11 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm26204-201 | ENSMUST00000082906 | 107 nt | BASIC | -4,39 | □□□□□ -3,11 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22313-201 | ENSMUST00000158008 | 129 nt | BASIC | -4,4 | □□□□□ -3,11 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22602-201 | ENSMUST00000157596 | 95 nt | BASIC | -4,41 | □□□□□ -3,12 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22401-201 | ENSMUST00000174927 | 117 nt | BASIC | -4,41 | □□□□□ -3,12 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm25978-201 | ENSMUST00000158698 | 90 nt | BASIC | -4,42 | □□□□□ -3,12 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm23461-201 | ENSMUST00000083265 | 107 nt | BASIC | -4,42 | □□□□□ -3,12 | | |
Gm21972 | J3QN38 | AC140930.2-201 | ENSMUST00000221803 | 109 nt | BASIC | -4,43 | □□□□□ -3,12 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm29107-201 | ENSMUST00000190910 | 347 nt | BASIC | -4,44 | □□□□□ -3,12 | | |
Gm21972 | J3QN38 | AC165138.1-201 | ENSMUST00000226984 | 270 nt | BASIC | -4,44 | □□□□□ -3,12 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm26231-201 | ENSMUST00000175218 | 67 nt | BASIC | -4,45 | □□□□□ -3,12 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22699-201 | ENSMUST00000175376 | 105 nt | BASIC | -4,45 | □□□□□ -3,12 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Mir28c-201 | ENSMUST00000200096 | 75 nt | BASIC | -4,46 | □□□□□ -3,12 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm26109-201 | ENSMUST00000083970 | 70 nt | BASIC | -4,46 | □□□□□ -3,12 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm10663-201 | ENSMUST00000098716 | 66 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | -4,46 | □□□□□ -3,12 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm24449-201 | ENSMUST00000083985 | 106 nt | BASIC | -4,47 | □□□□□ -3,13 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm23676-201 | ENSMUST00000157314 | 105 nt | BASIC | -4,48 | □□□□□ -3,13 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm28211-201 | ENSMUST00000190920 | 315 nt | BASIC | -4,48 | □□□□□ -3,13 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm37646-201 | ENSMUST00000191756 | 111 nt | BASIC | -4,48 | □□□□□ -3,13 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm24225-201 | ENSMUST00000158825 | 98 nt | BASIC | -4,49 | □□□□□ -3,13 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm27686-201 | ENSMUST00000185123 | 91 nt | BASIC | -4,49 | □□□□□ -3,13 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm37889-201 | ENSMUST00000194174 | 251 nt | BASIC | -4,5 | □□□□□ -3,13 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm25623-201 | ENSMUST00000157216 | 108 nt | BASIC | -4,51 | □□□□□ -3,13 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm23811-201 | ENSMUST00000175155 | 84 nt | BASIC | -4,52 | □□□□□ -3,13 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm24842-201 | ENSMUST00000158681 | 54 nt | BASIC | -4,53 | □□□□□ -3,13 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm24097-201 | ENSMUST00000178720 | 107 nt | BASIC | -4,53 | □□□□□ -3,13 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm27554-201 | ENSMUST00000185074 | 98 nt | BASIC | -4,53 | □□□□□ -3,13 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm2077-201 | ENSMUST00000195017 | 319 nt | BASIC | -4,54 | □□□□□ -3,14 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm22573-201 | ENSMUST00000082982 | 102 nt | BASIC | -4,54 | □□□□□ -3,14 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm24016-201 | ENSMUST00000157726 | 68 nt | BASIC | -4,55 | □□□□□ -3,14 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm23066-201 | ENSMUST00000158237 | 71 nt | BASIC | -4,55 | □□□□□ -3,14 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm26159-201 | ENSMUST00000158968 | 104 nt | BASIC | -4,55 | □□□□□ -3,14 | | |
Gm21972 | J3QN38 | Gm20108-201 | ENSMUST00000219977 | 153 nt | BASIC | -4,55 | □□□□□ -3,14 | | |
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92,1 ms