Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir122-201ENSMUST00000083468 66 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22197-201ENSMUST00000116866 58 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26125-201ENSMUST00000083357 107 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj33-201ENSMUST00000103708 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.31□□□□□ -2.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25862-201ENSMUST00000158250 129 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22464-201ENSMUST00000175273 64 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-3.38□□□□□ -2.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122210.2-201ENSMUST00000220216 115 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27554-201ENSMUST00000185074 98 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22385-201ENSMUST00000158189 101 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7218-201ENSMUST00000200050 59 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22783-201ENSMUST00000104089 107 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-3.59□□□□□ -2.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24673-201ENSMUST00000116948 124 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23108-201ENSMUST00000178295 124 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23751-201ENSMUST00000157583 136 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir367-201ENSMUST00000083479 75 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27366-201ENSMUST00000184967 108 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir379-201ENSMUST00000083564 66 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23817-201ENSMUST00000158449 104 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC161271.1-201ENSMUST00000226914 150 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23421-201ENSMUST00000158934 104 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25995-201ENSMUST00000175396 142 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44351-201ENSMUST00000200090 95 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms