Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm23961-201ENSMUST00000104685 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm25326-201ENSMUST00000101903 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm24377-201ENSMUST00000104398 131 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm22746-201ENSMUST00000082494 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Spocd1B1ASB6 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm23573-201ENSMUST00000104408 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm25222-201ENSMUST00000158199 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm24710-201ENSMUST00000175235 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm24135-201ENSMUST00000179085 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Spocd1B1ASB6 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Spocd1B1ASB6 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Spocd1B1ASB6 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Spocd1B1ASB6 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 284.9 ms