Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Snord16a-201ENSMUST00000083895 99 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Col4a3Q9QZS0 Snord123-201ENSMUST00000158692 71 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Mirlet7a-2-201ENSMUST00000175029 96 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm24003-201ENSMUST00000158455 100 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-0.88□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-0.88□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Mir29b-1-201ENSMUST00000083670 71 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Mir1969-201ENSMUST00000157623 94 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
Col4a3Q9QZS0 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm24051-201ENSMUST00000158622 75 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm24775-201ENSMUST00000157377 99 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm22385-201ENSMUST00000158189 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Col4a3Q9QZS0 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.1 ms