Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0
Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Col4a3 | Q9QZS0 | Snord16a-201 | ENSMUST00000083895 | 99 nt | BASIC | -0,81 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm24522-201 | ENSMUST00000083964 | 108 nt | BASIC | -0,81 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm25010-201 | ENSMUST00000158403 | 65 nt | BASIC | -0,82 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm23384-201 | ENSMUST00000158593 | 103 nt | BASIC | -0,82 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir669j-201 | ENSMUST00000179023 | 121 nt | BASIC | -0,82 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir7015-201 | ENSMUST00000199525 | 64 nt | BASIC | -0,82 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Snord80-201 | ENSMUST00000083801 | 81 nt | BASIC | -0,82 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Zfp813-ps-201 | ENSMUST00000186652 | 2506 nt | BASIC | -0,83 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm22606-201 | ENSMUST00000158290 | 103 nt | BASIC | -0,83 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm26097-201 | ENSMUST00000179642 | 93 nt | BASIC | -0,83 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir7086-201 | ENSMUST00000183683 | 65 nt | BASIC | -0,83 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm45125-201 | ENSMUST00000206908 | 151 nt | BASIC | -0,83 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Snord57-201 | ENSMUST00000083338 | 72 nt | BASIC | -0,83 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm11250-201 | ENSMUST00000142137 | 306 nt | TSL 5 BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm22951-201 | ENSMUST00000179471 | 107 nt | BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm27905-201 | ENSMUST00000184005 | 207 nt | BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm24612-201 | ENSMUST00000083267 | 107 nt | BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm25410-201 | ENSMUST00000083758 | 137 nt | BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm27263-201 | ENSMUST00000184760 | 76 nt | BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm28925-201 | ENSMUST00000188586 | 168 nt | BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm43038-201 | ENSMUST00000202359 | 88 nt | BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | AC126939.1-201 | ENSMUST00000224943 | 226 nt | BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm26124-201 | ENSMUST00000083359 | 108 nt | BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Snord123-201 | ENSMUST00000158692 | 71 nt | BASIC | -0,85 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | 4921527H02Rik-201 | ENSMUST00000196028 | 246 nt | BASIC | -0,85 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm44409-201 | ENSMUST00000198810 | 166 nt | BASIC | -0,85 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm22558-201 | ENSMUST00000157326 | 95 nt | BASIC | -0,86 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm24131-201 | ENSMUST00000158539 | 107 nt | BASIC | -0,86 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm25716-201 | ENSMUST00000158628 | 104 nt | BASIC | -0,86 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm22503-201 | ENSMUST00000158983 | 115 nt | BASIC | -0,86 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mirlet7a-2-201 | ENSMUST00000175029 | 96 nt | BASIC | -0,87 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir466b-8-201 | ENSMUST00000103883 | 86 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm24003-201 | ENSMUST00000158455 | 100 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm8034-201 | ENSMUST00000178853 | 132 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir466e-201 | ENSMUST00000198862 | 84 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir466c-1-201 | ENSMUST00000200654 | 84 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm43977-201 | ENSMUST00000203970 | 189 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm24054-201 | ENSMUST00000158619 | 105 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm22699-201 | ENSMUST00000175376 | 105 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm23017-201 | ENSMUST00000177583 | 72 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm17522-202 | ENSMUST00000186631 | 174 nt | TSL 1 (best) BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm17412-202 | ENSMUST00000189566 | 174 nt | TSL 1 (best) BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm23316-201 | ENSMUST00000157997 | 114 nt | BASIC | -0,89 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir21b-201 | ENSMUST00000184317 | 108 nt | BASIC | -0,89 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm25482-201 | ENSMUST00000083225 | 107 nt | BASIC | -0,89 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm25599-201 | ENSMUST00000157816 | 103 nt | BASIC | -0,9 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm22101-201 | ENSMUST00000157928 | 103 nt | BASIC | -0,9 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm23261-201 | ENSMUST00000158316 | 136 nt | BASIC | -0,9 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir29b-1-201 | ENSMUST00000083670 | 71 nt | BASIC | -0,9 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir1969-201 | ENSMUST00000157623 | 94 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm27937-201 | ENSMUST00000183605 | 88 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir451b-201 | ENSMUST00000196157 | 72 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,55 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir1948-201 | ENSMUST00000157325 | 85 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm23258-201 | ENSMUST00000158319 | 106 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm22165-201 | ENSMUST00000158414 | 103 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir466b-1-201 | ENSMUST00000177988 | 82 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm26454-201 | ENSMUST00000082682 | 107 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm23607-201 | ENSMUST00000104550 | 126 nt | BASIC | -0,92 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm25493-201 | ENSMUST00000157375 | 103 nt | BASIC | -0,92 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm25889-201 | ENSMUST00000157775 | 107 nt | BASIC | -0,92 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm25440-201 | ENSMUST00000158279 | 154 nt | BASIC | -0,92 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm18502-201 | ENSMUST00000218679 | 199 nt | BASIC | -0,92 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm20108-201 | ENSMUST00000219977 | 153 nt | BASIC | -0,92 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir702-201 | ENSMUST00000102285 | 109 nt | BASIC | -0,93 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Snord64-201 | ENSMUST00000104003 | 67 nt | BASIC | -0,93 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm24717-201 | ENSMUST00000157522 | 124 nt | BASIC | -0,93 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm24051-201 | ENSMUST00000158622 | 75 nt | BASIC | -0,93 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm43324-201 | ENSMUST00000197482 | 289 nt | BASIC | -0,93 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm24134-201 | ENSMUST00000083361 | 71 nt | BASIC | -0,93 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm24070-201 | ENSMUST00000104519 | 130 nt | BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm27549-201 | ENSMUST00000183508 | 62 nt | BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | 9230110F11Rik-202 | ENSMUST00000212907 | 191 nt | TSL 5 BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | AC132833.2-201 | ENSMUST00000228699 | 157 nt | BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir741-201 | ENSMUST00000103931 | 71 nt | BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm23209-201 | ENSMUST00000158667 | 110 nt | BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm24842-201 | ENSMUST00000158681 | 54 nt | BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm22459-201 | ENSMUST00000082577 | 108 nt | BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm23461-201 | ENSMUST00000083265 | 107 nt | BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir669b-201 | ENSMUST00000102172 | 97 nt | BASIC | -0,95 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm25619-201 | ENSMUST00000122621 | 104 nt | BASIC | -0,95 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm24775-201 | ENSMUST00000157377 | 99 nt | BASIC | -0,95 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm25641-201 | ENSMUST00000175135 | 108 nt | BASIC | -0,95 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | AC122327.1-201 | ENSMUST00000220778 | 108 nt | BASIC | -0,95 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | AC140930.2-201 | ENSMUST00000221803 | 109 nt | BASIC | -0,95 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm25915-201 | ENSMUST00000104265 | 126 nt | BASIC | -0,96 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm22672-201 | ENSMUST00000104414 | 134 nt | BASIC | -0,96 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm22385-201 | ENSMUST00000158189 | 101 nt | BASIC | -0,96 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir5619-201 | ENSMUST00000176065 | 61 nt | BASIC | -0,96 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm45492-201 | ENSMUST00000211611 | 288 nt | BASIC | -0,96 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm24201-201 | ENSMUST00000082946 | 125 nt | BASIC | -0,96 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm23173-201 | ENSMUST00000157161 | 160 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Gm25626-201 | ENSMUST00000177631 | 107 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir669a-7-201 | ENSMUST00000180364 | 87 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir669a-6-201 | ENSMUST00000196127 | 87 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir669a-12-201 | ENSMUST00000197274 | 87 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir669a-5-201 | ENSMUST00000197439 | 87 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir669a-10-201 | ENSMUST00000197745 | 87 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir669a-11-201 | ENSMUST00000197952 | 87 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir669a-4-201 | ENSMUST00000198665 | 87 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Col4a3 | Q9QZS0 | Mir669a-9-201 | ENSMUST00000200087 | 87 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
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