Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0,7□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Gm24377-201ENSMUST00000104398 131 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-0,71□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC-0,72□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC-0,72□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0,72□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC-0,72□□□□□ -2,52
Zbed3Q9D0L1 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm24336-201ENSMUST00000104203 146 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm24296-201ENSMUST00000158297 106 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0,76□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC-0,76□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Mir574-201ENSMUST00000103854 78 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm27610-201ENSMUST00000184026 74 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Mir5124b-201ENSMUST00000184251 85 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Zbed3Q9D0L1 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC-0,79□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC-0,79□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC-0,79□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC-0,79□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm24372-201ENSMUST00000104400 110 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm22234-201ENSMUST00000174906 65 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm24971-201ENSMUST00000175581 110 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC-0,83□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC-0,83□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0,83□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Zbed3Q9D0L1 Mir7094-2-201ENSMUST00000184622 60 ntBASIC-0,85□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC-0,85□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC-0,85□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm44311-201ENSMUST00000196448 69 ntBASIC-0,85□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Mir7094-1-201ENSMUST00000199671 60 ntBASIC-0,85□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm22813-202ENSMUST00000200346 124 ntBASIC-0,85□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm25431-201ENSMUST00000101978 107 ntBASIC-0,86□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC-0,86□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC-0,86□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC-0,86□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC-0,87□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC-0,87□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC-0,87□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Mir677-202ENSMUST00000197076 78 ntBASIC-0,87□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC-0,87□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC-0,88□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC-0,88□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC-0,88□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC-0,89□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC-0,89□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC-0,89□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC-0,89□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC-0,89□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Mir145b-201ENSMUST00000184434 75 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm27784-201ENSMUST00000184926 113 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Zbed3Q9D0L1 Gm24714-201ENSMUST00000102382 101 ntBASIC-0,91□□□□□ -2,56
Zbed3Q9D0L1 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC-0,91□□□□□ -2,56
Zbed3Q9D0L1 Cyp2j7-ps1-201ENSMUST00000122430 173 ntBASIC-0,91□□□□□ -2,56
Zbed3Q9D0L1 Gm42773-201ENSMUST00000196962 148 ntBASIC-0,91□□□□□ -2,56
Zbed3Q9D0L1 Mir466f-1-201ENSMUST00000104779 94 ntBASIC-0,92□□□□□ -2,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124,3 ms