Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8
Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir467a-2-201 | ENSMUST00000179447 | 83 nt | BASIC | 0,61 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir467a-9-201 | ENSMUST00000179752 | 83 nt | BASIC | 0,61 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir467a-4-201 | ENSMUST00000179923 | 83 nt | BASIC | 0,61 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir467a-8-201 | ENSMUST00000180070 | 83 nt | BASIC | 0,61 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22302-201 | ENSMUST00000082657 | 106 nt | BASIC | 0,61 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir219b-201 | ENSMUST00000198317 | 65 nt | BASIC | 0,6 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm44345-201 | ENSMUST00000199560 | 135 nt | BASIC | 0,6 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm26438-201 | ENSMUST00000082593 | 107 nt | BASIC | 0,6 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir669h-201 | ENSMUST00000116944 | 125 nt | BASIC | 0,59 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Rab11fip4os2-202 | ENSMUST00000132921 | 355 nt | TSL 1 (best) BASIC | 0,59 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm43885-201 | ENSMUST00000204928 | 2542 nt | BASIC | 0,58 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25991-201 | ENSMUST00000102439 | 99 nt | BASIC | 0,57 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25055-201 | ENSMUST00000157369 | 76 nt | BASIC | 0,57 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm27975-201 | ENSMUST00000184400 | 101 nt | BASIC | 0,57 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm44932-201 | ENSMUST00000206799 | 121 nt | BASIC | 0,57 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | AC156794.1-201 | ENSMUST00000214415 | 214 nt | TSL 5 BASIC | 0,57 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25328-201 | ENSMUST00000175013 | 107 nt | BASIC | 0,56 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm26285-201 | ENSMUST00000177923 | 107 nt | BASIC | 0,56 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | CT571266.1-201 | ENSMUST00000222859 | 153 nt | BASIC | 0,56 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23622-201 | ENSMUST00000082460 | 107 nt | BASIC | 0,56 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | n-R5s96-201 | ENSMUST00000082574 | 124 nt | BASIC | 0,56 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22454-201 | ENSMUST00000082583 | 107 nt | BASIC | 0,56 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23652-201 | ENSMUST00000116752 | 107 nt | BASIC | 0,55 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24183-201 | ENSMUST00000122572 | 93 nt | BASIC | 0,55 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25112-201 | ENSMUST00000122680 | 104 nt | BASIC | 0,55 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22431-201 | ENSMUST00000158545 | 107 nt | BASIC | 0,55 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25161-201 | ENSMUST00000158913 | 132 nt | BASIC | 0,55 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm43038-201 | ENSMUST00000202359 | 88 nt | BASIC | 0,55 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25633-201 | ENSMUST00000178565 | 107 nt | BASIC | 0,54 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22805-201 | ENSMUST00000082739 | 107 nt | BASIC | 0,54 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22950-201 | ENSMUST00000082776 | 107 nt | BASIC | 0,54 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24258-201 | ENSMUST00000083739 | 133 nt | BASIC | 0,54 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25870-201 | ENSMUST00000179845 | 79 nt | BASIC | 0,53 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm44803-201 | ENSMUST00000204384 | 156 nt | BASIC | 0,53 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir18-201 | ENSMUST00000083469 | 96 nt | BASIC | 0,53 | □□□□□ -2,32 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24555-201 | ENSMUST00000104548 | 124 nt | BASIC | 0,52 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23605-201 | ENSMUST00000157255 | 127 nt | BASIC | 0,52 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm26207-201 | ENSMUST00000082909 | 104 nt | BASIC | 0,52 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm14533-201 | ENSMUST00000117088 | 93 nt | BASIC | 0,51 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm26104-201 | ENSMUST00000157250 | 108 nt | BASIC | 0,51 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22542-201 | ENSMUST00000158166 | 95 nt | BASIC | 0,51 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24884-201 | ENSMUST00000158784 | 119 nt | BASIC | 0,51 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | AC125190.3-201 | ENSMUST00000223224 | 121 nt | BASIC | 0,5 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm26303-201 | ENSMUST00000116845 | 119 nt | BASIC | 0,49 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23468-201 | ENSMUST00000157125 | 108 nt | BASIC | 0,49 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22340-201 | ENSMUST00000157717 | 114 nt | BASIC | 0,49 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25993-201 | ENSMUST00000175391 | 80 nt | BASIC | 0,49 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm27475-201 | ENSMUST00000183420 | 61 nt | BASIC | 0,49 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm29432-201 | ENSMUST00000185397 | 139 nt | BASIC | 0,49 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Scarna8-201 | ENSMUST00000158333 | 131 nt | BASIC | 0,48 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm43432-201 | ENSMUST00000196352 | 121 nt | BASIC | 0,48 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm42677-201 | ENSMUST00000196363 | 127 nt | BASIC | 0,48 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24580-201 | ENSMUST00000103965 | 131 nt | BASIC | 0,47 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25307-201 | ENSMUST00000158885 | 106 nt | BASIC | 0,47 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Snord50a-201 | ENSMUST00000178154 | 72 nt | BASIC | 0,47 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24463-201 | ENSMUST00000178417 | 72 nt | BASIC | 0,47 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22981-201 | ENSMUST00000082611 | 75 nt | BASIC | 0,47 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | n-R5s12-201 | ENSMUST00000083785 | 119 nt | BASIC | 0,47 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24445-201 | ENSMUST00000083981 | 107 nt | BASIC | 0,47 | □□□□□ -2,33 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24288-201 | ENSMUST00000157630 | 144 nt | BASIC | 0,46 | □□□□□ -2,34 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24772-201 | ENSMUST00000158507 | 110 nt | BASIC | 0,46 | □□□□□ -2,34 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23020-201 | ENSMUST00000158766 | 253 nt | BASIC | 0,46 | □□□□□ -2,34 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm26007-201 | ENSMUST00000158798 | 120 nt | BASIC | 0,46 | □□□□□ -2,34 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24162-201 | ENSMUST00000093665 | 102 nt | BASIC | 0,46 | □□□□□ -2,34 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25247-201 | ENSMUST00000175475 | 90 nt | BASIC | 0,45 | □□□□□ -2,34 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25322-201 | ENSMUST00000122556 | 104 nt | BASIC | 0,44 | □□□□□ -2,34 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22759-201 | ENSMUST00000102276 | 96 nt | BASIC | 0,43 | □□□□□ -2,34 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Traj9-201 | ENSMUST00000103731 | 58 nt | APPRIS P1 BASIC | 0,43 | □□□□□ -2,34 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir3108-201 | ENSMUST00000175500 | 79 nt | BASIC | 0,43 | □□□□□ -2,34 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23672-201 | ENSMUST00000157471 | 107 nt | BASIC | 0,42 | □□□□□ -2,34 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir1197-201 | ENSMUST00000117037 | 120 nt | BASIC | 0,41 | □□□□□ -2,34 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25375-201 | ENSMUST00000158157 | 135 nt | BASIC | 0,41 | □□□□□ -2,34 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Snora26-201 | ENSMUST00000175614 | 121 nt | BASIC | 0,4 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm28001-201 | ENSMUST00000183561 | 117 nt | BASIC | 0,4 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir3065-201 | ENSMUST00000198674 | 87 nt | BASIC | 0,4 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm44828-201 | ENSMUST00000203745 | 106 nt | BASIC | 0,4 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25644-201 | ENSMUST00000083209 | 107 nt | BASIC | 0,39 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25061-201 | ENSMUST00000104665 | 107 nt | BASIC | 0,38 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24833-201 | ENSMUST00000116775 | 120 nt | BASIC | 0,38 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22720-201 | ENSMUST00000122710 | 87 nt | BASIC | 0,38 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm43206-201 | ENSMUST00000197990 | 114 nt | BASIC | 0,38 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22458-201 | ENSMUST00000082576 | 107 nt | BASIC | 0,38 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25798-201 | ENSMUST00000082641 | 107 nt | BASIC | 0,38 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm14947-201 | ENSMUST00000133704 | 303 nt | BASIC | 0,37 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm26116-201 | ENSMUST00000175600 | 77 nt | BASIC | 0,37 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | mt-Tw-201 | ENSMUST00000082397 | 67 nt | BASIC | 0,37 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25296-201 | ENSMUST00000082566 | 67 nt | BASIC | 0,37 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25619-201 | ENSMUST00000122621 | 104 nt | BASIC | 0,35 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24868-201 | ENSMUST00000157265 | 136 nt | BASIC | 0,35 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm26152-201 | ENSMUST00000157427 | 101 nt | BASIC | 0,35 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24077-201 | ENSMUST00000158183 | 136 nt | BASIC | 0,35 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm26359-201 | ENSMUST00000158873 | 101 nt | BASIC | 0,35 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir7077-201 | ENSMUST00000183991 | 57 nt | BASIC | 0,35 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25681-201 | ENSMUST00000083938 | 106 nt | BASIC | 0,35 | □□□□□ -2,35 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23969-201 | ENSMUST00000083324 | 74 nt | BASIC | 0,34 | □□□□□ -2,36 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir224-201 | ENSMUST00000083608 | 82 nt | BASIC | 0,34 | □□□□□ -2,36 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir196a-2-201 | ENSMUST00000083554 | 85 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25609-201 | ENSMUST00000104019 | 104 nt | BASIC | 0,32 | □□□□□ -2,36 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25542-201 | ENSMUST00000116889 | 94 nt | BASIC | 0,32 | □□□□□ -2,36 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23788-201 | ENSMUST00000122535 | 106 nt | BASIC | 0,32 | □□□□□ -2,36 | | |
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