Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
NischQ80TM9 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
NischQ80TM9 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
NischQ80TM9 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
NischQ80TM9 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
NischQ80TM9 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
NischQ80TM9 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
NischQ80TM9 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
NischQ80TM9 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
NischQ80TM9 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
NischQ80TM9 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Mir1969-201ENSMUST00000157623 94 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NischQ80TM9 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm23909-201ENSMUST00000104598 131 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NischQ80TM9 Gm24775-201ENSMUST00000157377 99 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-2□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-2□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NischQ80TM9 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
NischQ80TM9 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
NischQ80TM9 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
NischQ80TM9 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
NischQ80TM9 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
NischQ80TM9 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
NischQ80TM9 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
NischQ80TM9 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
NischQ80TM9 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NischQ80TM9 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NischQ80TM9 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
NischQ80TM9 Gm23751-201ENSMUST00000157583 136 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 AC122210.2-201ENSMUST00000220216 115 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-2.1□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Mir122-201ENSMUST00000083468 66 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Traj33-201ENSMUST00000103708 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.11□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Gm22464-201ENSMUST00000175273 64 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Gm22197-201ENSMUST00000116866 58 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NischQ80TM9 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
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