Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
Rnf40Q3U319 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rnf40Q3U319 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rnf40Q3U319 Gm22746-201ENSMUST00000082494 107 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rnf40Q3U319 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rnf40Q3U319 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rnf40Q3U319 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1,7□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC1,7□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC1,7□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1,7□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm25222-201ENSMUST00000158199 126 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1,66□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm24710-201ENSMUST00000175235 101 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm24135-201ENSMUST00000179085 101 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1,66□□□□□ -2,14
Rnf40Q3U319 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1,65□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,64□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1,64□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1,63□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm25326-201ENSMUST00000101903 107 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm23573-201ENSMUST00000104408 107 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,61□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
Rnf40Q3U319 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1,57□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC1,57□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1,56□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1,55□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC1,54□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC1,54□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 Gm22357-201ENSMUST00000082882 83 ntBASIC1,54□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC1,54□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1,53□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1,53□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC1,53□□□□□ -2,16
Rnf40Q3U319 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC1,52□□□□□ -2,17
Rnf40Q3U319 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1,52□□□□□ -2,17
Rnf40Q3U319 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC1,51□□□□□ -2,17
Rnf40Q3U319 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC1,51□□□□□ -2,17
Rnf40Q3U319 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC1,51□□□□□ -2,17
Rnf40Q3U319 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC1,51□□□□□ -2,17
Rnf40Q3U319 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC1,5□□□□□ -2,17
Rnf40Q3U319 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1,5□□□□□ -2,17
Rnf40Q3U319 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1,5□□□□□ -2,17
Rnf40Q3U319 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1,49□□□□□ -2,17
Rnf40Q3U319 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1,49□□□□□ -2,17
Rnf40Q3U319 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1,49□□□□□ -2,17
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