Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC0,48□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC0,47□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC0,47□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC0,47□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC0,47□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC0,47□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC0,47□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC0,47□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC0,47□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC0,47□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0,47□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC0,47□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC0,47□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC0,47□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0,47□□□□□ -2,33
Trim71Q1PSW8 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0,46□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC0,46□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC0,46□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC0,46□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC0,46□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC0,46□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC0,46□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC0,46□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC0,46□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC0,46□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC0,46□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0,46□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC0,46□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC0,46□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC0,45□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC0,45□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC0,45□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0,45□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC0,45□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC0,45□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC0,45□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC0,45□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC0,45□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC0,44□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC0,44□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC0,44□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC0,44□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC0,44□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC0,44□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC0,44□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC0,44□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC0,44□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC0,43□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC0,42□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC0,42□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm22095-201ENSMUST00000158984 150 ntBASIC0,42□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC0,42□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC0,42□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC0,42□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC0,42□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC0,42□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0,41□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC0,41□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC0,41□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC0,41□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC0,41□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24331-201ENSMUST00000175099 67 ntBASIC0,41□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0,41□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm23801-201ENSMUST00000175561 67 ntBASIC0,41□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24485-201ENSMUST00000178283 67 ntBASIC0,41□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC0,41□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC0,41□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0,41□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC0,41□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC0,41□□□□□ -2,34
Trim71Q1PSW8 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC0,4□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0,4□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC0,4□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC0,4□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC0,4□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0,4□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC0,4□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC0,4□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC0,39□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC0,39□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm26485-201ENSMUST00000158019 64 ntBASIC0,39□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC0,39□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC0,39□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC0,39□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC0,39□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC0,39□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC0,39□□□□□ -2,35
Trim71Q1PSW8 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC0,38□□□□□ -2,35
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