Protein–RNA interactions for Protein: P28700
Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Rxra | P28700 | Olfr1099-202 | ENSMUST00000213456 | 4867 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 0,39 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | AC154506.4-201 | ENSMUST00000224898 | 3416 nt | BASIC | 0,38 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Gm22205-201 | ENSMUST00000122655 | 71 nt | BASIC | 0,38 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Gm23672-201 | ENSMUST00000157471 | 107 nt | BASIC | 0,38 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Gm27607-201 | ENSMUST00000185162 | 122 nt | BASIC | 0,38 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Gm25622-201 | ENSMUST00000157217 | 104 nt | BASIC | 0,37 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Gm25160-201 | ENSMUST00000158914 | 102 nt | BASIC | 0,37 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Mir3473d-201 | ENSMUST00000175346 | 81 nt | BASIC | 0,37 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | AC156794.1-201 | ENSMUST00000214415 | 214 nt | TSL 5 BASIC | 0,37 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Gm26441-201 | ENSMUST00000082590 | 104 nt | BASIC | 0,37 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Snord95-201 | ENSMUST00000082846 | 68 nt | BASIC | 0,37 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Gm23038-201 | ENSMUST00000083873 | 104 nt | BASIC | 0,37 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Gm23652-201 | ENSMUST00000116752 | 107 nt | BASIC | 0,36 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Gm24183-201 | ENSMUST00000122572 | 93 nt | BASIC | 0,36 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Gm23531-201 | ENSMUST00000104567 | 68 nt | BASIC | 0,35 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Gm42845-201 | ENSMUST00000197766 | 105 nt | BASIC | 0,35 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Gm44932-201 | ENSMUST00000206799 | 121 nt | BASIC | 0,35 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Mir196a-2-201 | ENSMUST00000083554 | 85 nt | BASIC | 0,35 | □□□□□ -2,35 | | |
Rxra | P28700 | Gm25408-201 | ENSMUST00000104104 | 133 nt | BASIC | 0,34 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir1197-201 | ENSMUST00000117037 | 120 nt | BASIC | 0,34 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm23500-201 | ENSMUST00000157735 | 98 nt | BASIC | 0,34 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm27475-201 | ENSMUST00000183420 | 61 nt | BASIC | 0,34 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir7065-201 | ENSMUST00000185110 | 61 nt | BASIC | 0,34 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm26438-201 | ENSMUST00000082593 | 107 nt | BASIC | 0,34 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm22950-201 | ENSMUST00000082776 | 107 nt | BASIC | 0,34 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm25696-201 | ENSMUST00000082900 | 105 nt | BASIC | 0,34 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm25022-201 | ENSMUST00000102205 | 83 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir467a-6-201 | ENSMUST00000177790 | 83 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir467a-3-201 | ENSMUST00000178082 | 83 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir467a-7-201 | ENSMUST00000178635 | 83 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir467a-10-201 | ENSMUST00000179320 | 83 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir467a-5-201 | ENSMUST00000179352 | 83 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir467a-2-201 | ENSMUST00000179447 | 83 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir467a-9-201 | ENSMUST00000179752 | 83 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir467a-4-201 | ENSMUST00000179923 | 83 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir467a-8-201 | ENSMUST00000180070 | 83 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir7077-201 | ENSMUST00000183991 | 57 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm44828-201 | ENSMUST00000203745 | 106 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | CT571266.1-201 | ENSMUST00000222859 | 153 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm22454-201 | ENSMUST00000082583 | 107 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm26104-201 | ENSMUST00000157250 | 108 nt | BASIC | 0,32 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm25656-201 | ENSMUST00000158466 | 66 nt | BASIC | 0,32 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm27975-201 | ENSMUST00000184400 | 101 nt | BASIC | 0,32 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm23468-201 | ENSMUST00000157125 | 108 nt | BASIC | 0,31 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm25055-201 | ENSMUST00000157369 | 76 nt | BASIC | 0,31 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm23180-201 | ENSMUST00000158686 | 125 nt | BASIC | 0,31 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm25328-201 | ENSMUST00000175013 | 107 nt | BASIC | 0,31 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | CT009723.2-201 | ENSMUST00000215702 | 124 nt | TSL 5 BASIC | 0,31 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm22805-201 | ENSMUST00000082739 | 107 nt | BASIC | 0,31 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm23969-201 | ENSMUST00000083324 | 74 nt | BASIC | 0,31 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm25756-201 | ENSMUST00000103990 | 136 nt | BASIC | 0,3 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir669h-201 | ENSMUST00000116944 | 125 nt | BASIC | 0,3 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm25112-201 | ENSMUST00000122680 | 104 nt | BASIC | 0,3 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm26152-201 | ENSMUST00000157427 | 101 nt | BASIC | 0,3 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Scarna8-201 | ENSMUST00000158333 | 131 nt | BASIC | 0,3 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir224-201 | ENSMUST00000083608 | 82 nt | BASIC | 0,3 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm23994-201 | ENSMUST00000158059 | 88 nt | BASIC | 0,29 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm44345-201 | ENSMUST00000199560 | 135 nt | BASIC | 0,29 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm43038-201 | ENSMUST00000202359 | 88 nt | BASIC | 0,29 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm24162-201 | ENSMUST00000093665 | 102 nt | BASIC | 0,29 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir710-201 | ENSMUST00000102088 | 110 nt | BASIC | 0,28 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm25991-201 | ENSMUST00000102439 | 99 nt | BASIC | 0,28 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm26007-201 | ENSMUST00000158798 | 120 nt | BASIC | 0,28 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Snord50a-201 | ENSMUST00000178154 | 72 nt | BASIC | 0,28 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm24463-201 | ENSMUST00000178417 | 72 nt | BASIC | 0,28 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm25870-201 | ENSMUST00000179845 | 79 nt | BASIC | 0,28 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Gm26207-201 | ENSMUST00000082909 | 104 nt | BASIC | 0,28 | □□□□□ -2,36 | | |
Rxra | P28700 | Mir669f-201 | ENSMUST00000103850 | 121 nt | BASIC | 0,27 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm24580-201 | ENSMUST00000103965 | 131 nt | BASIC | 0,27 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm14533-201 | ENSMUST00000117088 | 93 nt | BASIC | 0,27 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm25322-201 | ENSMUST00000122556 | 104 nt | BASIC | 0,27 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm44803-201 | ENSMUST00000204384 | 156 nt | BASIC | 0,27 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm45741-201 | ENSMUST00000212661 | 152 nt | TSL 1 (best) BASIC | 0,27 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Mir18-201 | ENSMUST00000083469 | 96 nt | BASIC | 0,27 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm23020-201 | ENSMUST00000158766 | 253 nt | BASIC | 0,26 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm24884-201 | ENSMUST00000158784 | 119 nt | BASIC | 0,26 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm25993-201 | ENSMUST00000175391 | 80 nt | BASIC | 0,26 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Mir3108-201 | ENSMUST00000175500 | 79 nt | BASIC | 0,26 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm29432-201 | ENSMUST00000185397 | 139 nt | BASIC | 0,26 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm6358-201 | ENSMUST00000089101 | 156 nt | APPRIS ALT2 BASIC | 0,26 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | n-R5s18-201 | ENSMUST00000122740 | 121 nt | BASIC | 0,25 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm22542-201 | ENSMUST00000158166 | 95 nt | BASIC | 0,25 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm22088-201 | ENSMUST00000158341 | 117 nt | BASIC | 0,25 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm25307-201 | ENSMUST00000158885 | 106 nt | BASIC | 0,25 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Mir6896-201 | ENSMUST00000198033 | 73 nt | BASIC | 0,25 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | AC125190.3-201 | ENSMUST00000223224 | 121 nt | BASIC | 0,25 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm22981-201 | ENSMUST00000082611 | 75 nt | BASIC | 0,25 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | n-R5s12-201 | ENSMUST00000083785 | 119 nt | BASIC | 0,25 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm22720-201 | ENSMUST00000122710 | 87 nt | BASIC | 0,24 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm42677-201 | ENSMUST00000196363 | 127 nt | BASIC | 0,24 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Traj9-201 | ENSMUST00000103731 | 58 nt | APPRIS P1 BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm25061-201 | ENSMUST00000104665 | 107 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Mir5124a-201 | ENSMUST00000175528 | 72 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Mir6365-201 | ENSMUST00000183990 | 101 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm43206-201 | ENSMUST00000197990 | 114 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm22458-201 | ENSMUST00000082576 | 107 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm25644-201 | ENSMUST00000083209 | 107 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm25497-201 | ENSMUST00000104425 | 132 nt | BASIC | 0,22 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm14947-201 | ENSMUST00000133704 | 303 nt | BASIC | 0,22 | □□□□□ -2,37 | | |
Rxra | P28700 | Gm24868-201 | ENSMUST00000157265 | 136 nt | BASIC | 0,22 | □□□□□ -2,37 | | |
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