Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC1,46□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1,45□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1,45□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1,44□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1,44□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC1,44□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC1,44□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC1,44□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC1,44□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC1,43□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC1,43□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1,43□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1,43□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1,43□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC1,43□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC1,42□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1,42□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC1,42□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC1,42□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1,42□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1,42□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1,41□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1,41□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1,4□□□□□ -2,18
Spocd1B1ASB6 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC1,4□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1,4□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1,4□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1,4□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1,4□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1,4□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC1,4□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1,39□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1,39□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC1,39□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1,38□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC1,38□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1,38□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1,38□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,37□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC1,37□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC1,37□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1,37□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,36□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC1,36□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC1,36□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC1,36□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1,36□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC1,35□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1,35□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC1,35□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC1,35□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,35□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC1,35□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC1,35□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1,34□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1,34□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC1,34□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC1,34□□□□□ -2,19
Spocd1B1ASB6 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC1,33□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC1,33□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,33□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1,32□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC1,32□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC1,32□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1,32□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1,32□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC1,32□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC1,32□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1,32□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1,32□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC1,32□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1,32□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1,32□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC1,31□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC1,31□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC1,31□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1,3□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1,3□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC1,3□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1,3□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC1,3□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1,3□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1,3□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1,3□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1,3□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC1,29□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC1,29□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1,29□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC1,29□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1,29□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1,29□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1,29□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC1,28□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC1,28□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1,28□□□□□ -2,2
Spocd1B1ASB6 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1,27□□□□□ -2,21
Spocd1B1ASB6 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1,27□□□□□ -2,21
Spocd1B1ASB6 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC1,27□□□□□ -2,21
Spocd1B1ASB6 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1,27□□□□□ -2,21
Spocd1B1ASB6 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC1,27□□□□□ -2,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms