Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Spocd1B1ASB6 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Spocd1B1ASB6 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Spocd1B1ASB6 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Spocd1B1ASB6 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.8 ms