Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E4

Ppp1r17, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 17, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r17Q9Z2E4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r17Q9Z2E4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms