Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms