Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms