Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr1Q9Z2C4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr1Q9Z2C4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms