Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccne2Q9Z238 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms