Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms