Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms