Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Sh3bp5Q9Z131 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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Sh3bp5Q9Z131 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Sh3bp5Q9Z131 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Sh3bp5Q9Z131 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Sh3bp5Q9Z131 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Sh3bp5Q9Z131 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Sh3bp5Q9Z131 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Sh3bp5Q9Z131 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5Q9Z131 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms