Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms