Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms