Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnurfQ9WU12 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms