Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PplQ9R269 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PplQ9R269 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PplQ9R269 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PplQ9R269 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PplQ9R269 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PplQ9R269 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PplQ9R269 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PplQ9R269 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PplQ9R269 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PplQ9R269 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PplQ9R269 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PplQ9R269 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PplQ9R269 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PplQ9R269 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PplQ9R269 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms