Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T2

Sae1, SUMO-activating enzyme subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sae1Q9R1T2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sae1Q9R1T2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sae1Q9R1T2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sae1Q9R1T2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sae1Q9R1T2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sae1Q9R1T2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sae1Q9R1T2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sae1Q9R1T2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sae1Q9R1T2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sae1Q9R1T2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sae1Q9R1T2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms