Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zeb2Q9R0G7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms