Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod3Q9R0E1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms