Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr54Q9R0D8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms