Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms