Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lamc3Q9R0B6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms